RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 FOXN1O15353 648 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 ORC4O43929 436 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 TRPA1O75762 1119 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 CAPN15O75808 1086 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 USP14P54578 494 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 TFAP4Q01664 338 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L2Q6R6M4 530 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 FEZ1Q99689 392 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.23■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 TSPY2A6NKD2 308 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 BTBD19C9JJ37 291 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 NT5C2P49902 561 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 HMGCS2P54868 508 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 ICA1Q05084 483 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 MTMR2Q13614 643 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 FAM47AQ5JRC9 791 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 ATP2B2Q01814 1243 aa16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 MOGSQ13724 837 aa16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 ACER1Q8TDN7 264 aa16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 SH2D4AQ9H788 454 aa16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.21■□□□□ 0.19
VPREB1-202ENST00000403807 PDHXO00330 501 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 ESR2Q92731 530 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 KRT23Q9C075 422 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 NBPF3Q9H094 633 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CNNM2Q9H8M5 875 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 NYAP2Q9P242 653 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TMX2Q9Y320 296 aa16.2■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 A0A1W2PRG0 241 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TBC1D8O95759 1140 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CYP21A2P08686 494 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TRDNQ13061 729 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.19■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 LAMB1P07942 1786 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 REC8O95072 547 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TTLL1O95922 423 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 OSBPP22059 807 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 RNF20Q5VTR2 975 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 MKL1Q969V6 931 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CEP95Q96GE4 821 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 C12orf42Q96LP6 360 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 PNMA3Q9UL41 463 aa16.18■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 DGKZQ13574 1117 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 NECTIN1Q15223 517 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CCDC178Q5BJE1 867 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TREML2Q5T2D2 321 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 VCPKMTQ9H867 229 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 GOPCQ9HD26 462 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 IL17RBQ9NRM6 502 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TSKSQ9UJT2 592 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 NEDD4P46934 1319 aa16.17■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 B4E1Z4 1266 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 E7EWF7 191 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 SLC27A2O14975 620 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 KDM4AO75164 1064 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 LBX1P52954 281 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CRHR2Q13324 411 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms