RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 NMT2O60551 498 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 LIG1P18858 919 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCNN1DP51172 638 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 EVX2Q03828 476 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRM4Q14833 912 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 DACT2Q5SW24 774 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PNMA1Q8ND90 353 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC192P0DO97 292 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 AOC3Q16853 763 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADALQ6DHV7 355 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PSMD1Q99460 953 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBSNQ9H1K0 784 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS33BQ9H267 617 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 DACT1Q9NYF0 836 aa15.03■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 C21orf2O43822 256 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 KINO60870 393 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 POLD1P28340 1107 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT2P35908 639 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 FUT2Q10981 343 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 FSIP1Q8NA03 581 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 MXD3Q9BW11 206 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -05e-9■■□□□ 11.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 STX8Q9UNK0 236 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLIC4Q9Y696 253 aa15.02■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP6R2O75170 966 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 GUCY1A2P33402 732 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC39A14Q15043 492 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 UVSSAQ2YD98 709 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PANK2Q9BZ23 570 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCDHA7Q9UN72 937 aa15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCG2P13521 617 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPEP1P16444 411 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TGFB2P61812 414 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PHF20Q9BVI0 1012 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 EHD4Q9H223 541 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 BTBD18B2RXH4 712 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 NR1I2O75469 434 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 BMP15O95972 392 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CALML3P27482 149 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 GABPAQ06546 454 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PKN1Q16512 942 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC17Q96LX7 622 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 IDI2Q9BXS1 227 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYH4Q9Y623 1939 aa14.99□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CUTAO60888 179 aa14.98□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms