RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343916.7

COL9A3-201, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL9A3, Length 2,485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-201ENST00000343916 USP17L8P0C7I0 530 aa22.19■■□□□ 1.14
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COL9A3-201ENST00000343916 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.18■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.18■■□□□ 1.14
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COL9A3-201ENST00000343916 TRIM75PA6NK02 468 aa22.17■■□□□ 1.14
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COL9A3-201ENST00000343916 DDAH1O94760 285 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 CALM1P0DP23 149 aa22.17■■□□□ 1.14
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COL9A3-201ENST00000343916 CALM3P0DP25 149 aa22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 NPY5RQ15761 445 aa22.17■■□□□ 1.14
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COL9A3-201ENST00000343916 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 SERPINC1P01008 464 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 UBASH3AP57075 661 aa22.16■■□□□ 1.14
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COL9A3-201ENST00000343916 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.16■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 A0A087X0B3 334 aa22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 ADAMTS3O15072 1205 aa22.15■■□□□ 1.14
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COL9A3-201ENST00000343916 ZNF174Q15697 407 aa22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 CFAP100Q494V2 611 aa22.15■■□□□ 1.14
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COL9A3-201ENST00000343916 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL9A3-201ENST00000343916 CEP135Q66GS9 1140 aa22.14■■□□□ 1.13
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COL9A3-201ENST00000343916 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 DHX58Q96C10 678 aa22.14■■□□□ 1.13
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COL9A3-201ENST00000343916 SBK1Q52WX2 424 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 SMARCE1Q969G3 411 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.14■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 TMEM232C9JQI7 657 aa22.13■■□□□ 1.13
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COL9A3-201ENST00000343916 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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COL9A3-201ENST00000343916 CNBD1Q8NA66 436 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 TNFRSF25Q93038 417 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 USP5P45974 858 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.13■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 LAMB1P07942 1786 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 CASP1P29466 404 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 TFAP4Q01664 338 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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COL9A3-201ENST00000343916 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 NHSQ6T4R5 1651 aa22.12■■□□□ 1.13
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COL9A3-201ENST00000343916 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 SCG2P13521 617 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 NLRP5P59047 1200 aa22.11■■□□□ 1.13
COL9A3-201ENST00000343916 MORC3Q14149 939 aa22.11■■□□□ 1.13
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