RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317058.7

SGF29-201, Transcript of SAGA complex associated factor 29, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGF29, Length 1,153 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29-201ENST00000317058 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.36■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 TOMM22Q9NS69 142 aa20.36■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 PCNTO95613 3336 aa20.36■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 NT5C2P49902 561 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 BACE1P56817 501 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 ICA1Q05084 483 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 MTMR2Q13614 643 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 PTPN18Q99952 460 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 RNF186Q9NXI6 227 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.35■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 TSPY2A6NKD2 308 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 USP14P54578 494 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 TFAP4Q01664 338 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 NBPF3Q9H094 633 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 SH2D4AQ9H788 454 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 INCENPQ9NQS7 918 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.34■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 BTBD19C9JJ37 291 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 HMGCS2P54868 508 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 MOGSQ13724 837 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 ACER1Q8TDN7 264 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.33■□□□□ 0.85
SGF29-201ENST00000317058 TRPA1O75762 1119 aa20.32■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 ATP2B2Q01814 1243 aa20.32■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.32■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 ESR2Q92731 530 aa20.32■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.32■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 MYH4Q9Y623 1939 aa20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 REC8O95072 547 aa20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 CYP21A2P08686 494 aa20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.843e-6■■■□□ 15.2
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SGF29-201ENST00000317058 KRT23Q9C075 422 aa20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 NYAP2Q9P242 653 aa20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.31■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 PDHXO00330 501 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 TRDNQ13061 729 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 CEP95Q96GE4 821 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 C12orf42Q96LP6 360 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 TMX2Q9Y320 296 aa20.3■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 NEDD4P46934 1319 aa20.29■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 A0A1W2PRG0 241 aa20.29■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 TTLL1O95922 423 aa20.29■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 RNF20Q5VTR2 975 aa20.29■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.29■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 PNMA3Q9UL41 463 aa20.29■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 FOXN1O15353 648 aa20.28■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 DGKZQ13574 1117 aa20.28■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 NECTIN1Q15223 517 aa20.28■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 TREML2Q5T2D2 321 aa20.28■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.28■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 GOPCQ9HD26 462 aa20.28■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.28■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 B4E1Z4 1266 aa20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 TBC1D8O95759 1140 aa20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 LPAR1Q92633 364 aa20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 MKL1Q969V6 931 aa20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 VCPKMTQ9H867 229 aa20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.27■□□□□ 0.84
SGF29-201ENST00000317058 E7EWF7 191 aa20.26■□□□□ 0.83
SGF29-201ENST00000317058 SLC27A2O14975 620 aa20.26■□□□□ 0.83
SGF29-201ENST00000317058 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SGF29-201ENST00000317058 KDM4AO75164 1064 aa20.26■□□□□ 0.83
SGF29-201ENST00000317058 OSBPP22059 807 aa20.26■□□□□ 0.83
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