RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Atoh1P48985 351 aa36.13■■■■□ 3.37
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Oog1E9Q5G7 496 aa36.12■■■■□ 3.37
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 TicrrQ8BQ33 1889 aa36.12■■■■□ 3.37
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Armc3A2AU72 881 aa36.11■■■■□ 3.37
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Stx8O88983 236 aa36.11■■■■□ 3.37
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pou3f3P31361 497 aa36.11■■■■□ 3.37
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Arl14Q3SXC5 192 aa36.11■■■■□ 3.37
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Btbd19S4R1I0 287 aa36.04■■■■□ 3.36
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Dicer1Q8R418 1916 aa36.04■■■■□ 3.36
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tmem59lQ7TNI2 337 aa36.03■■■■□ 3.36
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Syne4Q8CII8 388 aa36.03■■■■□ 3.36
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Usp33Q8R5K2 909 aa36.03■■■■□ 3.36
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cnpy3Q9DAU1 276 aa36.02■■■■□ 3.36
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Vmn2r23E9PXI5 849 aa36.01■■■■□ 3.36
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa36.01■■■■□ 3.36
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ccdc7Q9D541 371 aa35.99■■■■□ 3.35
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Plcg1Q62077 1302 aa35.97■■■■□ 3.35
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa35.97■■■■□ 3.35
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Trmt1Q3TX08 663 aa35.95■■■■□ 3.35
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Vta1Q9CR26 309 aa35.95■■■■□ 3.35
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Fsip1Q9D3V5 435 aa35.95■■■■□ 3.35
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Sp4Q62445 782 aa35.94■■■■□ 3.34
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rexo5D3YW29 759 aa35.93■■■■□ 3.34
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Fam83hQ148V8 1209 aa35.93■■■■□ 3.34
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
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