RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhl30Q8C3F7 581 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppm1fQ8CGA0 452 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vnn1Q9Z0K8 512 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp8b5A3FIN4 1183 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppfia3P60469 1194 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc51Q3URS9 406 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhl40Q9D783 621 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5624F6ZZG8 207 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3TYL0 343 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif22Q3V300 660 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hspa4Q61316 841 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Haus7Q8BKT8 364 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Col23a1Q8K4G2 532 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pla2g12bQ99P27 195 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pet2A2AHY8 747 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnni2P13412 182 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cep120Q7TSG1 988 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DymQ8CHY3 669 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acad12D3Z7X0 555 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnm1P39053 867 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnj4P52189 445 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdcp1Q5U462 833 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myl10Q62082 202 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr119Q7TRJ5 321 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8CEZ4 452 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PcQ05920 1178 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ncoa7Q6DFV7 943 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hps6Q8BLY7 805 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tc2nQ91XT6 489 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tomm22Q9CPQ3 142 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cep89Q9CZX2 791 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MicalclQ9D5U9 680 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pola2P33611 600 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Esyt2Q3TZZ7 845 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prom2Q3UUY6 835 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ehd2Q8BH64 543 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 9230110C19RikQ8CC70 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 WtapQ9ER69 396 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 StrcQ8VIM6 1809 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chd5A2A8L1 1946 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abl1P00520 1123 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HelbQ6NVF4 1074 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem179Q8BHH9 233 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nek9Q8K1R7 984 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt23Q99PS0 422 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cbx6Q9DBY5 414 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Magi2Q9WVQ1 1275 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sned1Q70E20 1403 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgra3Q7TT36 1310 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bnip3O55003 187 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgef6Q8K4I3 771 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspyl4Q8VD63 406 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trmt44Q9D2Q2 713 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Col4a5Q63ZW6 1691 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gng11P61953 73 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankk1Q8BZ25 745 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efcab8Q8C9R9 203 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vps53Q8CCB4 832 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 EcsitQ9QZH6 435 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dock5B2RY04 1868 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adssl1P28650 457 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uba5Q8VE47 403 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arl8aQ8VEH3 186 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MlphQ91V27 590 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bap1Q99PU7 728 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efcc1Q9JJF6 558 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp8b1Q148W0 1251 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Best3Q6H1V1 669 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adck5Q80V03 582 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BccipQ9CWI3 316 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700018B08RikQ9DA83 213 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp1a4Q9WV27 1032 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Diaph1O08808 1255 aa23.45■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pla2g4bP0C871 782 aa23.45■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Irx2P81066 474 aa23.45■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcm6P97311 821 aa23.45■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dok7Q18PE0 504 aa23.45■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmed8Q3UHI4 326 aa23.45■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pde5aQ8CG03 865 aa23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.2 ms