RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174939.1

Snord55-201, mousemouse

BASIC

Gene Snord55, Length 79 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snord55-201ENSMUST00000174939 Prr13Q9CQJ5 137 aa5.3□□□□□ -1.56
Snord55-201ENSMUST00000174939 SnurfQ9WU12 71 aa5.3□□□□□ -1.56
Snord55-201ENSMUST00000174939 Smim20D3Z7Q2 69 aa5.28□□□□□ -1.56
Snord55-201ENSMUST00000174939 Tmem258P61166 79 aa5.26□□□□□ -1.57
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm20661K7N787 53 aa5.24□□□□□ -1.57
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm19426M0QWC7 77 aa5.23□□□□□ -1.57
Snord55-201ENSMUST00000174939 SspoQ8CG65 4998 aa5.21□□□□□ -1.57
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa5.21□□□□□ -1.58
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa5.2□□□□□ -1.58
Snord55-201ENSMUST00000174939 BC029722A0A0N4SW31 51 aa5.18□□□□□ -1.58
Snord55-201ENSMUST00000174939 H2al1aQ5M8Q2 105 aa5.18□□□□□ -1.58
Snord55-201ENSMUST00000174939 H2al1eQ810S6 105 aa5.18□□□□□ -1.58
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm10382Q3V0T5 144 aa5.17□□□□□ -1.58
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm11569B1AQB1 180 aa5.16□□□□□ -1.58
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm10197F6QEY5 67 aa5.16□□□□□ -1.58
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm20537G3UYK7 97 aa5.12□□□□□ -1.59
Snord55-201ENSMUST00000174939 Brk1Q91VR8 75 aa5.11□□□□□ -1.59
Snord55-201ENSMUST00000174939 Serp1Q9Z1W5 66 aa5.11□□□□□ -1.59
Snord55-201ENSMUST00000174939 Phxr4P15974 95 aa5.09□□□□□ -1.59
Snord55-201ENSMUST00000174939 H2al1bA0A087WP11 105 aa5.08□□□□□ -1.6
Snord55-201ENSMUST00000174939 Uqcr11Q9CPX8 56 aa5.08□□□□□ -1.6
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sec61gP60060 68 aa5.07□□□□□ -1.6
Snord55-201ENSMUST00000174939 Limd2Q8BGB5 128 aa5.07□□□□□ -1.6
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap12-1Q9Z287 130 aa5.05□□□□□ -1.6
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1jD3YUU5 139 aa5.04□□□□□ -1.6
Snord55-201ENSMUST00000174939 SmcpP15265 143 aa5.03□□□□□ -1.6
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap9-5A2A5X3 358 aa5.02□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Spink7Q6IE32 76 aa5.02□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa5.02□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 CriptO70333 101 aa5.01□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap19-2Q925I0 141 aa5.01□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ndufb1P0DN34 57 aa4.99□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Pla2g10Q9QXX3 151 aa4.99□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rps28P62858 69 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap17-1A2A5X6 109 aa4.97□□□□□ -1.61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap19-9aF8WH65 55 aa4.96□□□□□ -1.62
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap4-2B1AQ85 167 aa4.94□□□□□ -1.62
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm9955Q8CEJ8 102 aa4.94□□□□□ -1.62
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm11562A0PK51 136 aa4.93□□□□□ -1.62
Snord55-201ENSMUST00000174939 Prm2P07978 107 aa4.92□□□□□ -1.62
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1gQ9D195 139 aa4.89□□□□□ -1.63
Snord55-201ENSMUST00000174939 Muc5bE9Q5I3 4800 aa4.84□□□□□ -1.63
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm17402F6Z0L5 76 aa4.81□□□□□ -1.64
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm11555B1AQ89 175 aa4.78□□□□□ -1.64
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sprr2a3Q4KL71 83 aa4.78□□□□□ -1.64
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa4.78□□□□□ -1.64
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm6358A0A087WPH4 74 aa4.77□□□□□ -1.65
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm11596B1AQB0 205 aa4.73□□□□□ -1.65
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa4.73□□□□□ -1.65
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1iQ9D6P5 149 aa4.73□□□□□ -1.65
Snord55-201ENSMUST00000174939 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
Snord55-201ENSMUST00000174939 H2al1kJ3QP08 105 aa4.68□□□□□ -1.66
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1a2Q9D1K4 149 aa4.65□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa4.64□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Pcp4P63054 62 aa4.63□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sox16Q62247 57 aa4.63□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm19668J3QMD1 248 aa4.62□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa4.59□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mt2P02798 61 aa4.59□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 4933415A04RikQ9D443 101 aa4.59□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 H2al1mQ9DAD9 105 aa4.59□□□□□ -1.67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ndufs5Q99LY9 106 aa4.57□□□□□ -1.68
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm11564A2A4L9 201 aa4.53□□□□□ -1.68
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm11563B1AQ90 168 aa4.53□□□□□ -1.68
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm11595B1AQA7 289 aa4.53□□□□□ -1.68
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap4-8B1AQA8 209 aa4.53□□□□□ -1.68
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm21887J3QQ04 176 aa4.52□□□□□ -1.69
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap8-1O08633 61 aa4.5□□□□□ -1.69
Snord55-201ENSMUST00000174939 Camk2n1Q6QWF9 78 aa4.5□□□□□ -1.69
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm12216A0A1W2P827 62 aa4.43□□□□□ -1.7
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm3646F6S692 53 aa4.41□□□□□ -1.7
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm10337F7DEP7 55 aa4.4□□□□□ -1.71
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap4-9B1AQA9 244 aa4.39□□□□□ -1.71
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa4.38□□□□□ -1.71
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap22-2J3QNX6 67 aa4.37□□□□□ -1.71
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa4.37□□□□□ -1.71
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mt4P47945 62 aa4.36□□□□□ -1.71
Snord55-201ENSMUST00000174939 Romo1P60603 79 aa4.32□□□□□ -1.72
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fsip2A2ARZ3 6995 aa4.27□□□□□ -1.73
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1bQ9D149 137 aa4.23□□□□□ -1.73
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa4.23□□□□□ -1.73
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sprr2kO70562 68 aa4.2□□□□□ -1.74
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa4.18□□□□□ -1.74
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa4.13□□□□□ -1.75
Snord55-201ENSMUST00000174939 2300003K06RikA2A4M0 262 aa4.13□□□□□ -1.75
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap4-7Q9D732 168 aa4.05□□□□□ -1.76
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1lQ9D1G7 135 aa4.04□□□□□ -1.76
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa4.03□□□□□ -1.76
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1hQ9D6R3 140 aa4.02□□□□□ -1.77
Snord55-201ENSMUST00000174939 Tnp1P10856 55 aa3.95□□□□□ -1.78
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa3.93□□□□□ -1.78
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sprr2gO70558 76 aa3.91□□□□□ -1.78
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm10272F7CZ33 110 aa3.87□□□□□ -1.79
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1dQ9D731 133 aa3.86□□□□□ -1.79
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce1a1Q9CQH5 143 aa3.81□□□□□ -1.8
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lce3bQ9CQM7 98 aa3.79□□□□□ -1.8
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa3.77□□□□□ -1.81
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sprr2iO70560 76 aa3.77□□□□□ -1.81
Snord55-201ENSMUST00000174939 A0A1Y7VJH8 109 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 91.1 ms