RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm11596B1AQB0 205 aa10,64□□□□□ -0,71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Coa5Q99M07 74 aa10,6□□□□□ -0,71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defb1P56386 69 aa10,58□□□□□ -0,72
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap3-1A2A591 98 aa10,49□□□□□ -0,73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa10,48□□□□□ -0,73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SptssbQ925E8 76 aa10,48□□□□□ -0,73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smlr1J3QMJ4 66 aa10,47□□□□□ -0,73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cox6b2Q80ZN9 88 aa10,46□□□□□ -0,73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa10,45□□□□□ -0,74
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm17606F6ZL36 78 aa10,37□□□□□ -0,75
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Muc5bE9Q5I3 4800 aa10,32□□□□□ -0,76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smim20D3Z7Q2 69 aa10,3□□□□□ -0,76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pet100P0DJE0 76 aa10,29□□□□□ -0,76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1jD3YUU5 139 aa10,28□□□□□ -0,76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prr13Q9CQJ5 137 aa10,28□□□□□ -0,76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap9-5A2A5X3 358 aa10,27□□□□□ -0,77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SnurfQ9WU12 71 aa10,27□□□□□ -0,77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa10,26□□□□□ -0,77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm19426M0QWC7 77 aa10,25□□□□□ -0,77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem258P61166 79 aa10,25□□□□□ -0,77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap19-2Q925I0 141 aa10,24□□□□□ -0,77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm20661K7N787 53 aa10,21□□□□□ -0,77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BC029722A0A0N4SW31 51 aa10,16□□□□□ -0,78
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa10,16□□□□□ -0,78
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa10,15□□□□□ -0,78
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm20537G3UYK7 97 aa10,13□□□□□ -0,79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10382Q3V0T5 144 aa10,11□□□□□ -0,79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2al1aQ5M8Q2 105 aa10,06□□□□□ -0,8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2al1eQ810S6 105 aa10,06□□□□□ -0,8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm11564A2A4L9 201 aa10,05□□□□□ -0,8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm11563B1AQ90 168 aa10,05□□□□□ -0,8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm11595B1AQA7 289 aa10,05□□□□□ -0,8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap4-8B1AQA8 209 aa10,05□□□□□ -0,8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP10,04□□□□□ -0,8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10197F6QEY5 67 aa10,01□□□□□ -0,81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap12-1Q9Z287 130 aa9,99□□□□□ -0,81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Phxr4P15974 95 aa9,94□□□□□ -0,82
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serp1Q9Z1W5 66 aa9,94□□□□□ -0,82
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Uqcr11Q9CPX8 56 aa9,92□□□□□ -0,82
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pla2g10Q9QXX3 151 aa9,92□□□□□ -0,82
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Limd2Q8BGB5 128 aa9,91□□□□□ -0,82
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CriptO70333 101 aa9,9□□□□□ -0,82
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Brk1Q91VR8 75 aa9,87□□□□□ -0,83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2al1bA0A087WP11 105 aa9,84□□□□□ -0,83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sec61gP60060 68 aa9,84□□□□□ -0,83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6358A0A087WPH4 74 aa9,83□□□□□ -0,84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap19-9aF8WH65 55 aa9,81□□□□□ -0,84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SmcpP15265 143 aa9,81□□□□□ -0,84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spink7Q6IE32 76 aa9,8□□□□□ -0,84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prm2P07978 107 aa9,78□□□□□ -0,84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap4-9B1AQA9 244 aa9,73□□□□□ -0,85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ndufb1P0DN34 57 aa9,73□□□□□ -0,85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rps28P62858 69 aaKnown RBP9,69□□□□□ -0,86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm9955Q8CEJ8 102 aa9,66□□□□□ -0,86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mt4P47945 62 aa9,55□□□□□ -0,88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm17402F6Z0L5 76 aa9,48□□□□□ -0,89
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sprr2a3Q4KL71 83 aa9,43□□□□□ -0,9
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa9,43□□□□□ -0,9
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1iQ9D6P5 149 aa9,4□□□□□ -0,9
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa9,39□□□□□ -0,91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fsip2A2ARZ3 6995 aa9,39□□□□□ -0,91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa9,33□□□□□ -0,92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa9,31□□□□□ -0,92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mt2P02798 61 aa9,26□□□□□ -0,93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1a2Q9D1K4 149 aa9,23□□□□□ -0,93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap8-1O08633 61 aa9,18□□□□□ -0,94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sprr2kO70562 68 aa9,16□□□□□ -0,94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1bQ9D149 137 aa9,1□□□□□ -0,95
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm19668J3QMD1 248 aa9,06□□□□□ -0,96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2al1kJ3QP08 105 aa9,06□□□□□ -0,96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1lQ9D1G7 135 aa9,02□□□□□ -0,97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sox16Q62247 57 aa9□□□□□ -0,97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa8,99□□□□□ -0,97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 2300003K06RikA2A4M0 262 aa8,98□□□□□ -0,97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4933415A04RikQ9D443 101 aa8,93□□□□□ -0,98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa8,9□□□□□ -0,98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2al1mQ9DAD9 105 aa8,89□□□□□ -0,99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcp4P63054 62 aa8,88□□□□□ -0,99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap4-7Q9D732 168 aa8,88□□□□□ -0,99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21887J3QQ04 176 aa8,83□□□□□ -1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap22-2J3QNX6 67 aa8,82□□□□□ -1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ndufs5Q99LY9 106 aa8,78□□□□□ -1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Camk2n1Q6QWF9 78 aa8,77□□□□□ -1,01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa8,61□□□□□ -1,03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3646F6S692 53 aa8,58□□□□□ -1,04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1a1Q9CQH5 143 aa8,58□□□□□ -1,04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm12216A0A1W2P827 62 aa8,57□□□□□ -1,04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sprr2gO70558 76 aa8,56□□□□□ -1,04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa8,5□□□□□ -1,05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10337F7DEP7 55 aa8,49□□□□□ -1,05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1hQ9D6R3 140 aa8,47□□□□□ -1,05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Romo1P60603 79 aa8,41□□□□□ -1,06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1eQ9D139 143 aa8,37□□□□□ -1,07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa8,29□□□□□ -1,08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eppk1Q8R0W0 6548 aa8,16□□□□□ -1,1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce1dQ9D731 133 aa8,08□□□□□ -1,12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 A0A1Y7VJH8 109 aa8,07□□□□□ -1,12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa7,92□□□□□ -1,14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa7,88□□□□□ -1,15
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sprr2iO70560 76 aa7,83□□□□□ -1,16
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