RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Romo1P60603 79 aa10,95□□□□□ -0,66
Trafd1-201ENSMUST00000042312 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa10,93□□□□□ -0,66
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 HydinQ80W93 5154 aa10,79□□□□□ -0,68
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Herc2Q4U2R1 4836 aa10,78□□□□□ -0,68
Trafd1-201ENSMUST00000042312 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa10,75□□□□□ -0,69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm21887J3QQ04 176 aa10,75□□□□□ -0,69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa10,73□□□□□ -0,69
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrp2A2ARV4 4660 aa10,64□□□□□ -0,71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa10,63□□□□□ -0,71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BC029722A0A0N4SW31 51 aa10,61□□□□□ -0,71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm19426M0QWC7 77 aa10,61□□□□□ -0,71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Birc6O88738 4882 aa10,61□□□□□ -0,71
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP10,39□□□□□ -0,75
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10318A0A1W2P728 225 aa10,35□□□□□ -0,75
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17402F6Z0L5 76 aa10,26□□□□□ -0,77
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spink7Q6IE32 76 aa10,11□□□□□ -0,79
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa10,1□□□□□ -0,79
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam229aB2KGE5 128 aa10,1□□□□□ -0,79
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa9,77□□□□□ -0,85
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Camk2n1Q6QWF9 78 aa9,65□□□□□ -0,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa9,64□□□□□ -0,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubr4A2AN08 5180 aa9,63□□□□□ -0,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fat4Q2PZL6 4981 aa9,53□□□□□ -0,88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ush2AQ2QI47 5193 aa9,51□□□□□ -0,89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1jD3YUU5 139 aa9,5□□□□□ -0,89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap1-3A2A588 173 aa9,48□□□□□ -0,89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hmcn2A2AJ76 5100 aa9,48□□□□□ -0,89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1mQ9CR91 182 aa9,44□□□□□ -0,9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 LorP18165 486 aa9,33□□□□□ -0,92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap12-1Q9Z287 130 aa9,31□□□□□ -0,92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap19-9aF8WH65 55 aa9,26□□□□□ -0,93
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap17-1A2A5X6 109 aa9,16□□□□□ -0,94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP9,15□□□□□ -0,94
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm18596A0A1W2P860 280 aa8,99□□□□□ -0,97
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap8-1O08633 61 aa8,86□□□□□ -0,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1a2Q9D1K4 149 aa8,85□□□□□ -0,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9112A2AI92 75 aa8,79□□□□□ -1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap19-2Q925I0 141 aa8,79□□□□□ -1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7735D3YX18 52 aa8,79□□□□□ -1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prm1P02319 51 aa8,79□□□□□ -1
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 SspoQ8CG65 4998 aa8,71□□□□□ -1,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa8,62□□□□□ -1,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa8,58□□□□□ -1,04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1hQ9D6R3 140 aa8,49□□□□□ -1,05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mt2P02798 61 aa8,25□□□□□ -1,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm6358A0A087WPH4 74 aa8,24□□□□□ -1,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10061D3Z714 54 aa8,23□□□□□ -1,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Muc5bE9Q5I3 4800 aa8,2□□□□□ -1,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1dQ9D731 133 aa7,99□□□□□ -1,13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1eQ9D139 143 aa7,73□□□□□ -1,17
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sprr2gO70558 76 aa7,71□□□□□ -1,18
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10272F7CZ33 110 aa7,69□□□□□ -1,18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11569B1AQB1 180 aa7,64□□□□□ -1,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11938Q9D3H4 131 aa7,59□□□□□ -1,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP7,55□□□□□ -1,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sprr2dO70555 85 aa7,54□□□□□ -1,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa7,5□□□□□ -1,21
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11562A0PK51 136 aa7,31□□□□□ -1,24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syne1Q6ZWR6 8799 aa7,12□□□□□ -1,27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1fB9EJP6 147 aa7,11□□□□□ -1,27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1a1Q9CQH5 143 aa7,11□□□□□ -1,27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce3bQ9CQM7 98 aa7,07□□□□□ -1,28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10100J3QK64 120 aa7,06□□□□□ -1,28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap19-4Q925H7 84 aa7,04□□□□□ -1,28
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa6,98□□□□□ -1,29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10142J3KMP7 120 aa6,91□□□□□ -1,3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce1gQ9D195 139 aa6,9□□□□□ -1,3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP6,81□□□□□ -1,32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa6,81□□□□□ -1,32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11555B1AQ89 175 aa6,76□□□□□ -1,33
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11596B1AQB0 205 aa6,7□□□□□ -1,34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lce3dE9Q8V1 98 aa6,7□□□□□ -1,34
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