RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	MUM2	P38236	366 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RTS1	P38903	757 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
CMR3	YPR013C	ELO3	P40319	345 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	DJP1	P40564	432 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	NGL3	Q03210	505 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	STP3	Q05937	343 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	FRE5	Q08908	694 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	SWT1	Q12104	458 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	DFG16	Q99234	619 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CMR3	YPR013C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	MRPL7	P36519	292 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YJL206C	P39529	758 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	BUD16	P39988	312 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	JEM1	P40358	645 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SSL2	Q00578	843 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ATG23	Q06671	453 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ISA2	Q12425	185 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SOD2	P00447	233 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	PDE1	P22434	369 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	GEX2	P36173	615 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SDH8	P38345	138 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	LNP1	P38878	278 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
CMR3	YPR013C	YJL068C	P40363	299 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	GLO1	P50107	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YNR061C	P53747	219 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	INN1	P53901	409 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ZDS2	P54786	942 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	MEH1	Q02205	184 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	TCO89	Q08921	799 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	LAS17	Q12446	633 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SPT7	P35177	1332 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ABF1	P14164	731 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	FUB1	P25659	250 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	CDC15	P27636	974 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	LIP5	P32875	414 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	LST4	P34239	828 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	PHO11	P35842	467 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ELF1	P36053	145 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	REG2	P38232	338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	PHO12	P38693	467 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	JHD1	P40034	492 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	RGI2	P40188	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	IME4	P41833	600 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	AVT1	P47082	602 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	VPS9	P54787	451 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	RMT2	Q03305	412 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	GTB1	Q04924	702 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	IRC13	Q08630	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	HIF1	Q12373	385 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SIR3	P06701	978 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	PMS1	P14242	873 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	KAR3	P17119	729 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SRB5	P32585	307 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ORC2	P32833	620 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	MAL33	P38157	468 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SRO77	P38163	1010 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	UBP13	P38187	747 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	CAJ1	P39101	391 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	FMP52	P40008	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YJL163C	P46996	555 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ECL1	P48235	211 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	IMO32	P53219	342 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	NNF2	P53253	936 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	MFM1	Q02783	413 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	USA1	Q03714	838 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	GRX6	Q12438	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	POL4	P25615	582 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ANP1	P32629	500 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	UBP11	P36026	717 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	MET18	P40469	1032 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	THI6	P41835	540 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YGR016W	P53209	190 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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