RNA–Protein interactions for RNA: YMR085W

YMR085W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YMR085W, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR085W	YMR085W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	DMC1	P25453	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	ANP1	P32629	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PPZ2	P33329	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	HEL1	P36113	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	UIP5	P36137	443 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	SIP3	P38717	1229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	LYS9	P38999	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	YJL206C	P39529	758 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	NUP60	P39705	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	IES5	P40060	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	YIL092W	P40497	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	SYG1	P40528	902 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	YGL242C	P53066	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	GYL1	Q04322	720 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	RNH1	Q04740	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	IRC3	Q06683	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	TAF3	Q12297	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	MHP1	P43638	1398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	NUP170	P38181	1502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PIF1	P07271	859 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PET122	P10355	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	DBF20	P32328	564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PET127	P32606	800 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	TFC3	P34111	1160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PXA2	P34230	853 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	ECM4	P36156	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	MRPL36	P36531	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	FAT1	P38225	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	SLX1	P38324	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	SFB3	P38810	929 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	PEX18	P38855	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	DNA2	P38859	1522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YMR085W	YMR085W	QRI7	P43122	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	SNX4	P47057	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	SGM1	P47166	707 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	BLS1	Q06071	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	HIM1	Q06674	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR085W	YMR085W	DRS2	P39524	1355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YEL043W	P32618	956 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RPC34	P32910	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YBR242W	P38331	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CAJ1	P39101	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	BDH2	P39713	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	VID27	P40157	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YIL166C	P40445	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SSN8	P47821	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MDR1	P53258	950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YGR266W	P53326	701 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ESBP6	P53918	673 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ARP4	P80428	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MGR3	Q04472	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HOS1	Q12214	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ARP7	Q12406	477 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ENT1	Q12518	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	BNR1	P40450	1375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
YMR085W	YMR085W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	VPH2	P32341	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RPN12	P32496	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	PEX2	P32800	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	BUD2	P33314	1104 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.8 ms