RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YML003W	P0CF16	290 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	ESL2	P36168	1195 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	CHS7	P38843	316 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	LNP1	P38878	278 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	UBP7	P40453	1071 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	MSE1	P48525	536 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	IMO32	P53219	342 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SUN4	P53616	420 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	REG1	Q00816	1014 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	TRS23	Q03784	219 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	NUS1	Q12063	375 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SWT1	Q12104	458 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	WHI2	P12611	486 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	ERG8	P24521	451 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	PSD1	P39006	500 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	GIP4	P39732	760 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	LAS21	P40367	830 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	IRC24	P40580	263 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	AAD10	P47182	288 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	COQ6	P53318	479 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	MUK1	Q02866	612 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	PUS9	Q12069	462 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	ZPS1	Q12512	249 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	MET8	P15807	274 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	AMD2	P22580	549 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	TFC3	P34111	1160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YMC2	P38087	329 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	MIT1	P40002	666 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	DJP1	P40564	432 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	LYS14	P40971	790 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.19	□□□□□ -1.58	not detected
RPS31	YLR167W	TIM44	Q01852	431 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	PSK2	Q08217	1101 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.19	□□□□□ -1.58	not detected
RPS31	YLR167W	BAG7	Q12128	409 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	IRC6	P43615	237 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YGR079W	P53249	370 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	CPR8	P53728	308 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YSA1	Q01976	231 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	MUB1	Q03162	620 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SPC19	Q03954	165 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	STP3	Q05937	343 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	LCB4	Q12246	624 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SGF29	P25554	259 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SRB5	P32585	307 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	HES1	P35843	434 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	PHM8	P40025	321 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SLZ1	P40167	298 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YGL117W	P53133	265 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YNR061C	P53747	219 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	TDA9	Q04545	1251 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YOR111W	Q99210	232 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	TPK2	P06245	380 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	PRE8	P23639	250 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YBR225W	P38321	900 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	ERC1	P38767	581 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	FLC2	P39719	783 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SDS3	P40505	327 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SGM1	P47166	707 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	STB4	P50104	949 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	INN1	P53901	409 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YML119W	Q03208	357 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YMR206W	Q03695	313 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	ENT4	Q07872	247 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YPL191C	Q08930	360 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	NMD4	Q12129	218 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	SCM3	Q12334	223 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPS31	YLR167W	FOB1	O13329	566 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	DMC1	P25453	334 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	GDA1	P32621	518 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	ALY1	P36117	915 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	NPA3	P47122	385 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	MSY1	P48527	492 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	COG2	P53271	262 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	UBP16	Q02863	499 aa		5.15	□□□□□ -1.59

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