RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL047W	YLL047W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	ICL2	Q12031	575 aa		5	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	BAG7	Q12128	409 aa		5	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	NPR3	P38742	1146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	SPC97	P38863	823 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	CFD1	P40558	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	VTC3	Q02725	835 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	CRC1	Q12289	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	URK1	P27515	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	LAC1	P28496	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	ACA1	P39970	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	BUD16	P39988	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	MNT3	P40549	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	CIN1	P40987	1014 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	SKP2	P42843	763 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	NPA3	P47122	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	SEC5	P89102	971 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	SUL2	Q12325	893 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	MSM1	P22438	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	PTC6	P25646	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	COQ3	P27680	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	PUG1	P40100	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	DJP1	P40564	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	YGR079W	P53249	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	HIM1	Q06674	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL047W	YLL047W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YCL049C	P25577	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	GSH1	P32477	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	PCI8	P40512	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	RGT2	Q12300	763 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	MRPL36	P36531	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YBR138C	P38277	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	JHD1	P40034	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	TPM2	P40414	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	UBX6	P47049	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	ORC5	P50874	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	TAM41	P53230	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	CLB4	P24871	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	PTH2	P34222	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	UBP7	P40453	1071 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	MSY1	P48527	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	THI3	Q07471	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	COX1	P00401	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	MTF2	P10849	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	SPO16	P17122	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	ARN1	P38731	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	ERV46	P39727	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YIL024C	P40543	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	GAT1	P43574	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	NUP120	P35729	1037 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	ASK1	P35734	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YJL107C	P42947	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	ZAP1	P47043	880 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YAP7	Q08182	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YPR089W	O13585	888 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	MSS51	P32335	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	XRS2	P33301	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	ASG1	P40467	964 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	CDC1	P40986	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL047W	YLL047W	CIA1	Q05583	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.6 ms