RNA–Protein interactions for RNA: YJR130C

STR2, Transcript of Cystathionine gamma-synthase, converts cysteine into cystathionine, yeast

Gene STR2, Length 1,920 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STR2	YJR130C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ATG21	Q02887	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	VPS64	Q03944	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RBA50	Q04418	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SNO4	Q04902	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	HSP32	Q08992	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ATG9	Q12142	997 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TAH18	Q12181	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TPK1	P06244	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
STR2	YJR130C	PGS1	P25578	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SKN7	P38889	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	VFA1	P40080	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	KHA1	P40309	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	POL31	P46957	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ILM1	P47155	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TEL2	P53038	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	VPS62	P53285	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RXT3	Q07458	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TGL5	Q12043	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SNF2	P22082	1703 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SEC12	P11655	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	MET8	P15807	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TUP1	P16649	713 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SRL3	P36167	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	CDS1	P38221	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
STR2	YJR130C	FTR1	P40088	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	BST1	P43571	1029 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	MFM1	Q02783	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	FAR8	Q05040	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SCM3	Q12334	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	CTT1	P06115	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	CTF13	P35203	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SIP3	P38717	1229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	GET2	P40056	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	LYS14	P40971	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	YDL183C	P48569	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	YAP1802	P53309	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	BSC5	P53755	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	MRPL19	P53875	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TRS31	Q03337	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RSM28	Q03430	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	BUD7	Q08754	746 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	COX17	Q12287	69 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	JIP3	O13555	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	CDC6	P09119	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	PEX1	P24004	1043 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	HIR2	P32480	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	NPL6	P32832	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RIB7	P33312	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	PCH2	P38126	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	PIH1	P38768	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	MEF2	P39677	819 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SYG1	P40528	902 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	IRC6	P43615	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	YAP6	Q03935	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	MGR3	Q04472	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ADY4	Q05955	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	STE23	Q06010	1027 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	NBP2	Q12163	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SKM1	Q12469	655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	DRS2	P39524	1355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TRP3	P00937	484 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	STE11	P23561	717 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	ATO2	P32907	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TOS1	P38288	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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