RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	GEX2	P36173	615 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	YER010C	P40011	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	COG2	P53271	262 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	GTB1	Q04924	702 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	HRD3	Q05787	833 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	UME6	P39001	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	SKP2	P42843	763 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	TDA10	P42938	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	NPA3	P47122	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	REG1	Q00816	1014 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	SNO4	Q04902	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	OPY2	Q06810	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	HSP32	Q08992	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	RER1	P25560	188 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	PSD1	P39006	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	PAC2	P39937	518 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	LAS21	P40367	830 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	PLM2	Q04383	521 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	CYK3	Q07533	885 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	BNR1	P40450	1375 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
RPC17	YJL011C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	CBF2	P32504	956 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	SIP1	P32578	815 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	CNS1	P33313	385 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	TMA16	Q08687	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	COX1	P00401	534 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	NUP120	P35729	1037 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	FMP10	P40098	244 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	VCX1	Q99385	411 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPC17	YJL011C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	PPZ2	P33329	710 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	HES1	P35843	434 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	FLO10	P36170	1169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	EXO1	P39875	702 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RIC1	P40395	1056 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	MNT3	P40549	630 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	OPT1	P40897	799 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YJL043W	P47053	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	ASE1	P50275	885 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	FMP30	Q02883	468 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	VPS72	Q03388	795 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	ARO10	Q06408	635 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	SWT1	Q12104	458 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YLR302C	O13544	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	SPO16	P17122	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	CHS3	P29465	1165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	MRP20	P32387	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YNR061C	P53747	219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	CBK1	P53894	756 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RAD34	Q06665	692 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	ATG23	Q06671	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	PCT1	P13259	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	ERG8	P24521	451 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YSP3	P25036	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	GSY2	P27472	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	LAC1	P28496	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RPC34	P32910	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
RPC17	YJL011C	UBP7	P40453	1071 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	SAE2	P46946	345 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	MSY1	P48527	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	AAT1	Q01802	451 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	DJP1	P40564	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 210.1 ms