RNA–Protein interactions for RNA: YHR170W

NMD3, Transcript of Protein involved in nuclear export of the large ribosomal subunit, yeast

Gene NMD3, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD3	YHR170W	TRE2	Q08693	809 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NMD3	YHR170W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NMD3	YHR170W	ECM3	Q99252	613 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NMD3	YHR170W	GAL1	P04385	528 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	PET111	P08468	800 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	SNA3	P14359	133 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	GLN3	P18494	730 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	STE11	P23561	717 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	EXO84	P38261	753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	TOK1	P40310	691 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	BRO1	P48582	844 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	AZR1	P50080	613 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	STB4	P50104	949 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	KAP114	P53067	1004 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	VPS62	P53285	467 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	BTN2	P53286	410 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	MET14	Q02196	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	MEH1	Q02205	184 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	PAH1	P32567	862 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	TRM2	P33753	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	PTH2	P34222	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	UIP5	P36137	443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	BUD16	P39988	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YTA12	P40341	825 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	LAM5	P43560	674 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	ASG7	P46993	209 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	SGM1	P47166	707 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	MAL11	P53048	616 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	URH1	Q04179	340 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	HFD1	Q04458	532 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	GIS3	Q12418	502 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	GAL10	P04397	699 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	KAR3	P17119	729 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	MEF1	P25039	761 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	FUN30	P31380	1131 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	AGP2	P38090	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	RRT2	P38332	387 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	HIS2	P38635	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YEL075C	P39972	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YER186C	P40101	306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	PHO86	P46956	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	JJJ1	P53863	590 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	ATG23	Q06671	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	DFG16	Q99234	619 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	PTP2	P29461	750 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	MAC1	P35192	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	RCK2	P38623	610 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	NDE1	P40215	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	ASG1	P40467	964 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	GCV2	P49095	1034 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YGR111W	P53265	400 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	PLB2	Q03674	706 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	RSM24	Q03976	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	PCD1	Q12524	340 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	RMP1	Q12530	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YLR462W	O13556	202 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	BI2	P03873	423 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	CHS1	P08004	1131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	CMP2	P14747	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	RPO26	P20435	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	CSE2	P33308	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	DOM34	P33309	386 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YHL049C	P38722	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	RIM4	P38741	713 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YHR054C	P38780	354 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NMD3	YHR170W	YER158C	P40095	573 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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