RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	DAL80	P26343	269 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	PSY4	P38193	441 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	IFA38	P38286	347 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	FMS1	P50264	508 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SHE10	P53075	577 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	HST1	P53685	503 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	MUB1	Q03162	620 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	FAR8	Q05040	523 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	GRC3	Q07845	632 aa		4	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	PDR11	P40550	1411 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	DNF2	Q12675	1612 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	PDE2	P06776	526 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	DPB3	P27344	201 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	JNM1	P36224	373 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	FZO1	P38297	855 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	MDV1	P47025	714 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YJR039W	P47107	1121 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YGR067C	P53243	804 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	MFM1	Q02783	413 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SYO1	Q07395	620 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SDH5	Q08230	162 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	BUD3	P25558	1636 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	FOB1	O13329	566 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ITR2	P30606	609 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	NGG1	P32494	702 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SSO1	P32867	290 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YKL063C	P35725	167 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	CCL1	P37366	393 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YAP3	P38749	330 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	RRF1	P38771	230 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	HXT7	P39004	570 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	GID8	P40208	455 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YJL070C	P40361	888 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	PEX14	P53112	341 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	HOL1	P53389	586 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ALF1	P53904	254 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ORC4	P54791	529 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ECM9	Q02202	377 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	DYN3	Q04949	312 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ATG17	Q06410	417 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	OPY2	Q06810	360 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	TGL5	Q12043	749 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	TRM13	Q12383	476 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	AUS1	Q08409	1394 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ARG81	P05085	880 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	BIK1	P11709	440 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	TYR1	P20049	452 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	HCM1	P25364	564 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	PGS1	P25578	521 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	KRE6	P32486	720 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YBR259W	P38338	688 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	TDA3	P38758	523 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	MTW1	P39731	289 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	FKH2	P41813	862 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	CIR1	P42940	261 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YJR120W	P47157	116 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	MIG2	P53035	382 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	MDR1	P53258	950 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	NRG1	Q03125	231 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	MLH2	Q07980	695 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YOR093C	Q12275	1648 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	NTO1	Q12311	748 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	TMA17	Q12513	150 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	MEI4	P29467	408 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SMI1	P32566	505 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	YHR112C	P38716	378 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	PIH1	P38768	344 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	CTM1	P38818	585 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SPT8	P38915	602 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	ILM1	P47155	203 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	SPO1	P53541	631 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RIM4	YHL024W	BSC5	P53755	489 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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