RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C FMP10P40098 244 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RLP7P40693 322 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MIC19P43594 170 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C STB4P50104 949 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ERP6P53198 216 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SLT2Q00772 484 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DON1Q05610 365 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RTR2Q12378 196 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VMR1P38735 1592 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C KIN2P13186 1147 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C KRE2P27809 442 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C AIM26P32858 118 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C POP2P39008 433 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SOL4P53315 255 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.24□□□□□ -1.89not detected
DOA4YDR069C VPS64Q03944 604 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HFD1Q04458 532 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NSE3Q05541 303 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YLR352WQ06479 807 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LOT6Q07923 191 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SMC5Q08204 1093 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YPL066WQ12194 479 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TIP41Q12199 356 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TRP3P00937 484 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C THS1P04801 734 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GCD1P09032 578 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FRS2P15625 503 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PRP9P19736 530 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ARE1P25628 610 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TOS1P38288 455 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C BCD1P38772 366 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MSS4P38994 779 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CIN5P40917 295 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PAC11P40960 533 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C OYE3P41816 400 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GOR1P53839 350 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VPS75P53853 264 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YNL193WP53870 558 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C KAP120Q02932 1032 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GCN5Q03330 439 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YDR131CQ03899 556 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HMO1Q03973 246 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GAD1Q04792 585 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GTB1Q04924 702 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VTH2P40890 1549 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LTE1P07866 1435 aa3.24□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C STF1P01098 86 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SEC63P14906 663 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MSD1P15179 658 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CKA2P19454 339 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RAD57P25301 460 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C AAD3P25612 363 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PPG1P32838 368 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C BUD2P33314 1104 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YKL100CP34248 587 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CAF4P36130 643 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GLG1P36143 616 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MAL33P38157 468 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PNT1P38969 423 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ABM1P47146 123 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YPT11P48559 417 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RFX1P48743 811 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ZIP2P53061 704 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MRM2P53123 320 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YGR067CP53243 804 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YGR111WP53265 400 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C BOP3P53958 396 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SVL3Q03088 825 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FCP1Q03254 732 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C USA1Q03714 838 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SSY1Q03770 852 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YDR179W-AQ03983 463 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NKP2Q06162 153 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YDR306CQ06640 478 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RSC58Q07979 502 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ACM1Q08981 209 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DCS2Q12123 353 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-ER2Q03619 1755 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-MR1Q04214 1755 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-NL1Q12112 1755 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-GR1Q12141 1755 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-BLQ12490 1755 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GAL1P04385 528 aa3.23□□□□□ -1.89
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