RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	YAP1802	P53309	568 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ARR3	Q06598	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	QCR6	P00127	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	GCN4	P03069	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	PXA2	P34230	853 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	EHT1	P38295	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TDP1	P38319	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TMN3	P40071	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SIP4	P46954	829 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ZAP1	P47043	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	UBC11	P52492	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	COS12	P53053	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	COG1	P53079	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YKU80	Q04437	629 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ATG23	Q06671	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	FRE5	Q08908	694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	BUD3	P25558	1636 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SGF29	P25554	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CTP1	P38152	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YBL029W	P38201	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YBR053C	P38235	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YAP3	P38749	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YJL206C	P39529	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	UBP7	P40453	1071 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	THI6	P41835	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CIR1	P42940	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	RFX1	P48743	811 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TAF11	Q04226	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ICL2	Q12031	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SUL2	Q12325	893 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SPT7	P35177	1332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SIR3	P06701	978 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	DAL5	P15365	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MET8	P15807	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YCR061W	P25639	631 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CDC15	P27636	974 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MRP20	P32387	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	LST4	P34239	828 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YBR225W	P38321	900 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	FMP52	P40008	231 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	LYS14	P40971	790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MPS3	P47069	682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	IZH3	Q07959	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	MLP2	P40457	1679 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	MYO4	P32492	1471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	PDE1	P22434	369 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	OCA4	P25366	362 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	ESL2	P36168	1195 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	FLC2	P39719	783 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	AAD10	P47182	288 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	CKA1	P15790	372 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	LOT5	P34234	306 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	RKM3	P38222	552 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUS1	YDL193W	MUM2	P38236	366 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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