RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 KRT86O43790 486 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 BMP6P22004 513 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CASP14P31944 242 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 APBA1Q02410 837 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ITIH3Q06033 890 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 DDR1Q08345 913 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 MTF1Q14872 753 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CHST3Q7LGC8 479 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CNPY4Q8N129 248 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CABS1Q96KC9 395 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 NBPF4Q96M43 638 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 RUFY1Q96T51 708 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 TOMM22Q9NS69 142 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 DONSONQ9NYP3 566 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CEP83Q9Y592 693 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.5□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB43O43298 467 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ZEB2O60315 1214 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 APPP05067 770 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CDC27P30260 824 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SEMA3FQ13275 785 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 PLCB4Q15147 1175 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ALS2CLQ60I27 953 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 GPATCH11Q8N954 259 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CLIC6Q96NY7 704 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.051e-7■■■□□ 17.5
HMBOX1-211ENST00000524238 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF1AQ12756 1690 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A087WZG4 1122 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 M0R2C6 588 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 EXOC5O00471 708 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 FGAP02671 866 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 IRAK1P51617 712 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 RCAN1P53805 252 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SKOR1P84550 965 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 DRP2Q13474 957 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 COPS6Q7L5N1 327 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 IQCDQ96DY2 449 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 MTA3Q9BTC8 594 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 GGA2Q9UJY4 613 aa8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 NID2Q14112 1375 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 MYH7P12883 1935 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 H0YHG0 523 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 EYA2O00167 538 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 N4BP3O15049 544 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 TEX33O43247 280 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 FSBPO95073 299 aa8.48□□□□□ -1.05
HMBOX1-211ENST00000524238 NDUFA10O95299 355 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms