RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429295.1

MRPL23-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL23, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-206ENST00000429295 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 HAUS7Q99871 368 aa26.56■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa26.56■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.56■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 CEP290O15078 2479 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 BCRP11274 1271 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 TTC6Q86TZ1 520 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 GINM1Q9NU53 330 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 UBXN2AP68543 259 aa26.54■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 PRKCZQ05513 592 aa26.54■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.54■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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MRPL23-206ENST00000429295 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 WDR18Q9BV38 432 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 FOCADQ5VW36 1801 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 GDF11O95390 407 aa26.52■■□□□ 1.84
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MRPL23-206ENST00000429295 TREML2Q5T2D2 321 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 RNF208Q9H0X6 261 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 EHD4Q9H223 541 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 PNMA3Q9UL41 463 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPL23-206ENST00000429295 SIPA1L1O43166 1804 aa26.51■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
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MRPL23-206ENST00000429295 JAG1P78504 1218 aa26.51■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 29.1
MRPL23-206ENST00000429295 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.51■■□□□ 1.83
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MRPL23-206ENST00000429295 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.51■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.51■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 ADD2P35612 726 aa26.5■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 SHISA4Q96DD7 197 aa26.5■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.5■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 GABRQQ9UN88 632 aa26.5■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.5■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 BACE1P56817 501 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 LCORLQ8N3X6 602 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 DPF3Q92784 378 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 GPATCH3Q96I76 525 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 C19orf81C9J6K1 198 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 H0YGN5 161 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 PLCD1P51178 756 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 MTMR2Q13614 643 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 USP17L10C9JJH3 530 aa26.47■■□□□ 1.83
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MRPL23-206ENST00000429295 GJA8P48165 433 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 UBE3CQ15386 1083 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 ARMT1Q9H993 441 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 ADCY3O60266 1144 aa26.46■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 GH2P01242 217 aa26.46■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.46■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 MYH1P12882 1939 aa26.45■■□□□ 1.83
MRPL23-206ENST00000429295 MBD4O95243 580 aa26.45■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 FLT3LGP49771 235 aa26.45■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.45■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 CRBNQ96SW2 442 aa26.45■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 HTATIP2Q9BUP3 242 aa26.45■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 ELNP15502 786 aa26.44■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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MRPL23-206ENST00000429295 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.44■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 COA7Q96BR5 231 aa26.44■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 UNC93B1Q9H1C4 597 aa26.44■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 CABP5Q9NP86 173 aa26.44■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.44■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 SHMT1P34896 483 aa26.43■■□□□ 1.82
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MRPL23-206ENST00000429295 INHAP05111 366 aa26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.41■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 PRKAB2O43741 272 aa26.41■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.41■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 IRF5Q13568 498 aa26.4■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 CHRDL2Q6WN34 429 aa26.4■■□□□ 1.82
MRPL23-206ENST00000429295 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.4■■□□□ 1.82
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