RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa33.93■■■■□ 3.02
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TRIOBP-209ENST00000428075 BACE1P56817 501 aa33.93■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 MTMR2Q13614 643 aa33.93■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa33.93■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa33.93■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 RAET1EQ8TD07 263 aa33.93■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
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TRIOBP-209ENST00000428075 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
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TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM34Q9BYJ4 488 aa33.91■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 GINM1Q9NU53 330 aa33.91■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 PNMA3Q9UL41 463 aa33.91■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF532Q9HCE3 1301 aa33.9■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa33.9■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 EHD4Q9H223 541 aa33.9■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
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TRIOBP-209ENST00000428075 EVX2Q03828 476 aa33.89■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM110CQ1W6H9 321 aa33.89■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 SLFNL1Q499Z3 407 aa33.89■■■■□ 3.02
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TRIOBP-209ENST00000428075 SERPINB13Q9UIV8 391 aa33.89■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 DOCK3Q8IZD9 2030 aa33.89■■■■□ 3.02
TRIOBP-209ENST00000428075 FLT3LGP49771 235 aa33.88■■■■□ 3.01
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TRIOBP-209ENST00000428075 GH2P01242 217 aa33.87■■■■□ 3.01
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TRIOBP-209ENST00000428075 USP17L10C9JJH3 530 aa33.85■■■■□ 3.01
TRIOBP-209ENST00000428075 CHGBP05060 677 aa33.85■■■■□ 3.01
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TRIOBP-209ENST00000428075 TTC6Q86TZ1 520 aa33.85■■■■□ 3.01
TRIOBP-209ENST00000428075 LCORLQ8N3X6 602 aa33.85■■■■□ 3.01
TRIOBP-209ENST00000428075 SHISA4Q96DD7 197 aa33.85■■■■□ 3.01
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TRIOBP-209ENST00000428075 EMILIN3Q9NT22 766 aa33.85■■■■□ 3.01
TRIOBP-209ENST00000428075 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
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TRIOBP-209ENST00000428075 GABPAQ06546 454 aa33.83■■■■□ 3.01
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TRIOBP-209ENST00000428075 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
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TRIOBP-209ENST00000428075 CYP2D6P10635 497 aa33.79■■■■□ 3
TRIOBP-209ENST00000428075 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
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TRIOBP-209ENST00000428075 ACER1Q8TDN7 264 aa33.78■■■■□ 3
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TRIOBP-209ENST00000428075 UNC93B1Q9H1C4 597 aa33.78■■■■□ 3
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TRIOBP-209ENST00000428075 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
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TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa33.74■■■□□ 2.99
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TRIOBP-209ENST00000428075 Q3C1V9 767 aa33.73■■■□□ 2.99
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP33.73■■■□□ 2.99
TRIOBP-209ENST00000428075 SEPT2Q15019 361 aa33.72■■■□□ 2.99
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