RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SYP-201ENST00000263233 PPFIBP1Q86W92 1011 aa16.98■□□□□ 0.31
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SYP-201ENST00000263233 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
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SYP-201ENST00000263233 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.97■□□□□ 0.31
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