RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlrp9aQ66X03 949 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmigd3G3X8R9 209 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ncf1Q09014 390 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc27Q3V036 639 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cfap52Q5F201 620 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam196bQ6GQV1 535 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam160b2Q80YR2 744 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cfap69Q8BH53 942 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Xrcc4Q924T3 326 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tjap1Q9DCD5 539 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rad9aQ9Z0F6 389 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MyocO70624 490 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prl7d1P04769 244 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cetn4Q8K4K1 168 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 1700018B08RikQ9DA83 213 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myh2G3UW82 1942 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prl3d1P18121 224 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mcm2P97310 904 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Krt25Q8VCW2 446 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fsip1Q9D3V5 435 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adgra3Q7TT36 1310 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pitpnm1O35954 1243 aa26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eef2P58252 858 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam228bQ497Q6 232 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddx4Q61496 702 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Exoc8Q6PGF7 716 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prb1Q91X93 504 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdzd3Q99MJ6 498 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ces1aE9PYP1 563 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vcam1P29533 739 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 StamP70297 548 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prr7Q3V0I2 269 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scnn1bQ9WU38 638 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Siah1aP61092 282 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nme8Q715T0 586 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bri3bpQ8BXV2 253 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stn1Q8K2X3 378 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CtshP49935 333 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam109bQ14B98 259 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fscn2Q32M02 492 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp957Q3UT76 567 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc85aQ5SP85 500 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpsm2Q8VDU0 679 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ube3bQ9ES34 1070 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Acot3Q9QYR7 432 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TnksQ6PFX9 1320 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pet2A2AHY8 747 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc146E9Q9F7 977 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myl6bQ8CI43 207 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mroh6V9GX81 722 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bdp1Q571C7 2467 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HmgcrQ01237 887 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GnptabQ69ZN6 1235 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dpp9Q8BVG4 862 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Piezo2Q8CD54 2822 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3138K7N754 218 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ZyxQ62523 564 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp341Q6PGC9 846 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rdm1Q9CQK3 281 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wfdc16A2A5H4 111 aa25.97■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Inpp5bQ8K337 993 aa25.97■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IrgqQ8VIM9 583 aa25.97■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bcar3Q9QZK2 820 aa25.97■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp4cP97470 307 aa25.96■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mrgprb1Q3UG61 350 aa25.96■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vps54Q5SPW0 977 aa25.96■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa25.96■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dusp4Q8BFV3 398 aa25.96■■□□□ 1.75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gjd2O54851 321 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptpn22P29352 802 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ProcP33587 460 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dpf3P58269 378 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbtb45Q52KG4 520 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Krt40Q6IFX3 439 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rhot2Q8JZN7 620 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lmcd1Q8VEE1 365 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trex1Q91XB0 314 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cndp2Q9D1A2 475 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa25.95■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 KhnynQ80U38 671 aa25.94■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Alpk1Q9CXB8 1231 aa25.94■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AoahO35298 574 aa25.93■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il17raQ60943 864 aa25.93■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prr11Q8BHE0 368 aa25.93■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ctu1Q99J10 420 aa25.93■■□□□ 1.74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlrc5C3VPR6 1915 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.7 ms