RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000139005.1

Hoxd3os1-202, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 1,701 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Krt85Q9Z2T6 507 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Prr14lE9Q7C4 1971 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Sparcl1P70663 650 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Atp8b1Q148W0 1251 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 R3hcc1Q8BSI6 488 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kcnk13Q8R1P5 405 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tm4sf4Q91XD3 202 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Add2Q9QYB8 725 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Bcorl1A2AQH4 1781 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Znf568E9PYI1 671 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ankrd35E9Q9D8 996 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Nkx1-1G3UXB3 402 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gm4340L7N2C4 268 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mapkapk5O54992 473 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pou3f3P31361 497 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Bach1P97302 739 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Znf697Q569E7 569 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 LdhdQ7TNG8 484 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Plcd1Q8R3B1 756 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Q9CYI0 393 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tanc1Q0VGY8 1856 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rsph10bE9PYQ0 876 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Speer4f2E9Q366 295 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Sept1P42209 366 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mcm5P49718 733 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Timm10P62073 90 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gabpb2P81069 414 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Uri1Q3TLD5 531 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Slc10a5Q5PT54 434 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fbxo33Q8VE08 562 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Polr3dQ91WD1 398 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Hdac9Q99N13 588 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cep83Q9D5R3 692 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Col11a1Q61245 1804 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Myh3P13541 1940 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Samd1D3YXK1 519 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 MecomP14404 1042 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pof1bQ8K4L4 587 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Eef2kO08796 724 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Atp8b2P98199 1209 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cnnm3Q32NY4 713 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tmem109Q3UBX0 243 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tll1Q62381 1013 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc66Q6NS45 935 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Srgap3Q812A2 1099 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Prune1Q8BIW1 454 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Maats1Q8BRC6 783 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tshz3Q8CGV9 1081 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zbtb3Q91X45 518 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Srgap1Q91Z69 1062 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Coro7Q9D2V7 922 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tgm5Q9D7I9 724 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Prg3Q9JL95 222 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dnai2A2AC93 623 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mmp8O70138 465 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mcm6P97311 821 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fam107bQ3TGF2 131 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Jakmip3Q5DTN8 844 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pde3bQ61409 1100 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tti2Q8BGV4 512 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Q8CEZ4 452 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Calcoco1Q8CGU1 691 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cep57l1Q8VDS7 400 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tubb6Q922F4 447 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Jag1Q9QXX0 1218 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Sik3Q6P4S6 1311 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 CpdO89001 1377 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Neurod6P48986 337 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Spata18Q0P557 537 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ctnna3Q65CL1 895 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pram1Q6BCL1 675 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 HunkO88866 714 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Samsn1P57725 372 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Erich4Q3UNU4 136 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Polr3gQ6NXY9 223 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Frat2Q8K025 231 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 NsmfQ99NF2 532 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Stag1Q9D3E6 1258 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Q9D9S1 216 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tsc2Q61037 1814 aa14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 OsbpQ3B7Z2 805 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.9 ms