RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063642.8

Ccdc30-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc30, Length 2,534 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Myo1bP46735 1107 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Kif22Q3V300 660 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Cyp7b1Q60991 507 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Pim2Q62070 370 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ubac1Q8VDI7 409 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Col20a1Q923P0 1320 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 NfixP70257 488 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ica1lQ3TY65 431 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Zkscan4Q5SZT6 480 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Znf653Q6YND2 615 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ints4Q8CIM8 964 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Sumf1Q8R0F3 372 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Tlcd1Q99JT6 247 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 RdxP26043 583 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Fam89aQ14BJ1 175 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Mum1l1Q4VA55 681 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Tmtc2Q56A06 836 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Prl2c1Q5SVL9 228 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ehd2Q8BH64 543 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Strip1Q8C079 837 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Large1Q9Z1M7 756 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Nmt2O70311 529 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Cdk4P30285 303 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ccdc51Q3URS9 406 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Cep120Q7TSG1 988 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 CpzQ8R4V4 654 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Uba5Q8VE47 403 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Tob2Q9JM55 345 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Epb41l3Q9WV92 929 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 EvplQ9D952 2035 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ptgs1P22437 602 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Tmem179Q8BHH9 233 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Inpp5bQ8K337 993 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Krt23Q99PS0 422 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 A0A1Y7VML8 143 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Vars2Q3U2A8 1060 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Kmt5bQ3U8K7 883 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Myl3P09542 204 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Tmed8Q3UHI4 326 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Cyp4x1Q6A152 507 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Larp6Q8BN59 492 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Sox30Q8CGW4 782 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Nup133Q8R0G9 1155 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Gm3893E9Q1I1 302 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Grin1P35438 938 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Filip1Q9CS72 1211 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Atp8b5A3FIN4 1183 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Gas1Q01721 343 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Lrrc8aQ80WG5 810 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Dnaaf4Q8R368 420 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 MbipQ99LQ1 341 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Clstn1Q9EPL2 979 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Vnn1Q9Z0K8 512 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Bend4P86174 541 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Triml1Q8BVP1 470 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Gimap7Q8R379 293 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Grin2dQ03391 1323 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Myh13B1AR69 1938 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ltn1Q6A009 1767 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Igsf9bE9PZ19 1328 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Stx8O88983 236 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 1700013D24RikQ0P521 120 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Psd3Q2PFD7 1037 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Fam198bQ3UPI1 517 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Olfr119Q7TRJ5 321 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Clec16aQ80U30 1036 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 DlatQ8BMF4 642 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Stn1Q8K2X3 378 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Dctpp1Q9QY93 170 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 PparaP23204 468 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ftl1P29391 183 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 SsbP32067 415 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 LrmpQ60664 539 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ift122Q6NWV3 1182 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Tekt3Q6X6Z7 490 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 St5Q924W7 1134 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Iqca1Q9CUL5 857 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Dock5B2RY04 1868 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ano3A2AHL1 981 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Phldb3E9QAF4 648 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 MycbpapQ5SUV2 932 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ccz1Q8C1Y8 480 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Ifi35Q9D8C4 286 aa14.54□□□□□ -0.08
Ccdc30-202ENSMUST00000063642 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.6 ms