Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
Myo1bP46735 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Myo1bP46735 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Myo1bP46735 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Myo1bP46735 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Myo1bP46735 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Myo1bP46735 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Myo1bP46735 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Myo1bP46735 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Myo1bP46735 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Myo1bP46735 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Myo1bP46735 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Myo1bP46735 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Myo1bP46735 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Myo1bP46735 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Myo1bP46735 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Myo1bP46735 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Myo1bP46735 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Myo1bP46735 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Myo1bP46735 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Myo1bP46735 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Myo1bP46735 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Myo1bP46735 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Myo1bP46735 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Myo1bP46735 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Myo1bP46735 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Myo1bP46735 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Myo1bP46735 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Myo1bP46735 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Myo1bP46735 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Myo1bP46735 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Myo1bP46735 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Myo1bP46735 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Myo1bP46735 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Myo1bP46735 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Myo1bP46735 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Myo1bP46735 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Myo1bP46735 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Myo1bP46735 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Myo1bP46735 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Myo1bP46735 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Myo1bP46735 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Myo1bP46735 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Myo1bP46735 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Myo1bP46735 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Myo1bP46735 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Myo1bP46735 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Myo1bP46735 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Myo1bP46735 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Myo1bP46735 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Myo1bP46735 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Myo1bP46735 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Myo1bP46735 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Myo1bP46735 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Myo1bP46735 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Myo1bP46735 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Myo1bP46735 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Myo1bP46735 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Myo1bP46735 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Myo1bP46735 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Myo1bP46735 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Myo1bP46735 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Myo1bP46735 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Myo1bP46735 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Myo1bP46735 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Myo1bP46735 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Myo1bP46735 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Myo1bP46735 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Myo1bP46735 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Myo1bP46735 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myo1bP46735 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Myo1bP46735 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Myo1bP46735 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Myo1bP46735 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Myo1bP46735 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Myo1bP46735 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Myo1bP46735 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Myo1bP46735 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Myo1bP46735 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Myo1bP46735 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Myo1bP46735 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Myo1bP46735 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Myo1bP46735 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myo1bP46735 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Myo1bP46735 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Myo1bP46735 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Myo1bP46735 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo1bP46735 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Myo1bP46735 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Myo1bP46735 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Myo1bP46735 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Myo1bP46735 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Myo1bP46735 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Myo1bP46735 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Myo1bP46735 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Myo1bP46735 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Myo1bP46735 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Myo1bP46735 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Myo1bP46735 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Myo1bP46735 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms