RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa8.57□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 S100a8P27005 89 aa8.57□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dnah8Q91XQ0 4731 aa8.57□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defa13P50711 93 aa8.56□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Smr3aQ61900 147 aa8.56□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 P01819 144 aa8.56□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CckP09240 115 aa8.56□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vps13bQ80TY5 3993 aa8.55□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam104aA2A6P4 185 aa8.55□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BtcQ05928 177 aa8.55□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 G0s2Q61585 103 aa8.55□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10770F7D043 238 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 SelenowP63300 88 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rab37Q9JKM7 223 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fat2Q5F226 4351 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 2310034G01RikA0A286YDL3 209 aa8.53□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pcp4l1Q6W8Q3 68 aa8.53□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dmac1Q9CQ00 111 aa8.53□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa8.53□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa8.52□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defa7P50705 93 aa8.52□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa8.52□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Klk12B2RVZ0 247 aa8.52□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10570F6VB42 170 aa8.52□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 A330070K13RikQ8CA53 115 aa8.52□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Scgb1b3J3QJY4 93 aa8.51□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Krtap14O08640 167 aa8.51□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cd164Q9R0L9 197 aa8.51□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10320E9PW43 113 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm9805F6YK59 57 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tnp2P11378 117 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 ScxQ64124 207 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm5142Q8C5X9 133 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lgals4Q8K419 326 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cox7cP17665 63 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defa4P28311 92 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tac4Q99N14 128 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q9DAA7 145 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trav13n-2A0A0G2JF93 110 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm11027G8JL69 66 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q9DAA3 117 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 HrnrQ8VHD8 2496 aa8.46□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adm2Q7TNK8 150 aa8.46□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defb47Q30KN1 79 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Spink13Q3UTS8 97 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm11011D3Z3L9 86 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl32-psP17932 135 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm7276Q3TYW4 209 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defb29Q8BGW9 78 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CenpwQ3URR0 86 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BC048502Q80Y74 154 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Phpt1Q9DAK9 124 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ube2bP63147 152 aa8.43□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Spata45Q9CVW4 97 aa8.43□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm17521F6QAC8 156 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 A0A286YCQ8 80 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccl25O35903 144 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Elof1P60003 83 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 MturnQ8CGA4 131 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fat3Q8BNA6 4555 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Wfdc10Q3V2J9 124 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Smim26Q3V460 107 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Msrb1Q9JLC3 116 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Birc6O88738 4882 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10642Q3TWM1 71 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa8.38□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Herc2Q4U2R1 4836 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10135F6TEE5 83 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 TeppQ6IMH0 216 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dnal4Q9DCM4 105 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm29423A0A087WRM1 55 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trav3-4A0A075B654 114 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv1-35A0A0G2JDE5 120 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Krtap19-5O08632 62 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10139O88245 57 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defb37Q7TMD2 62 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl39lQ9CQD0 51 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa8.33□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 D130052B06RikQ3UW13 202 aa8.33□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 AI606181Q8C7B9 129 aa8.33□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm27235Q3UW50 83 aa8.32□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Abca13Q5SSE9 5034 aa8.32□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa8.32□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa8.31□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vpreb2P13373 142 aa8.31□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 LbhQ9CX60 105 aa8.31□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa8.3□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm26602M0QWA4 95 aa8.3□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam19a3Q7TPG6 132 aa8.3□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa8.3□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.5 ms