RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-18A0A0B4J1J3 123 aa10.04□□□□□ -0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dppa2Q9CWH0 301 aa10.03□□□□□ -0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnah1E9Q8T7 4250 aa10.03□□□□□ -0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav13-1A0A075B644 110 aa10.03□□□□□ -0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stab1Q8R4Y4 2571 aa10.03□□□□□ -0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hivep1Q03172 2688 aa10.02□□□□□ -0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm16181B0V2H2 73 aa10.02□□□□□ -0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AplnQ9R0R4 77 aa10.02□□□□□ -0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smim26Q3V460 107 aa10.02□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnah17Q69Z23 4481 aa10.02□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa10.01□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5142Q8C5X9 133 aa10.01□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cox7bP56393 80 aa10.01□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv3-1A0A075B5P1 119 aa10□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa10□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnah10D3YYQ8 4591 aa10□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa9.99□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem213Q08EA8 116 aa9.99□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav3-4A0A075B654 114 aa9.98□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spata3Q9D9T6 193 aa9.98□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa9.98□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb29Q8BGW9 78 aa9.98□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm17509Q9CZ61 145 aa9.98□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01896 185 aa9.97□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MifP34884 115 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Xlr5cQ9JJR2 179 aa9.97□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav13-2A0A075B649 110 aa9.97□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa9.97□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv1-35A0A0G2JDE5 120 aa9.96□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1810062G17RikG3X8Y2 129 aa9.96□□□□□ -0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa9.96□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lyrm7Q9DA03 104 aa9.95□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AY074887Q8R5F9 132 aa9.94□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube2d4D3YUH6 135 aa9.93□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10518F6UQQ9 182 aa9.93□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10770F7D043 238 aa9.93□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Reg3bP35230 175 aa9.93□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnal4Q9DCM4 105 aa9.93□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav13n-2A0A0G2JF93 110 aa9.93□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wfdc12Q9JHY3 85 aa9.92□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa9.91□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 9430015G10RikA2ASP7 199 aa9.91□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb10Q8R2I8 73 aa9.91□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa9.91□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TnxbO35452 4006 aa9.91□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10320E9PW43 113 aa9.9□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spata45Q9CVW4 97 aa9.9□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sprr4Q8CGN8 76 aa9.9□□□□□ -0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ifitm6A0A1B0GS75 124 aa9.9□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cox7b2Q9D2H1 82 aa9.9□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa9.89□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm7137J3QMW1 236 aa9.89□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl39lQ9CQD0 51 aa9.89□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PtprqP0C5E4 2300 aa9.89□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv13-2A0A0A6YWN3 119 aa9.89□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dync2h1Q45VK7 4306 aa9.89□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa9.88□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Reg3dQ9QUS9 175 aa9.88□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Xcl1P47993 114 aa9.88□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa2P28309 93 aa9.87□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp5eP56382 52 aa9.87□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa9.86□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 VwfQ8CIZ8 2813 aa9.86□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AW011738F6S7Q2 159 aa9.86□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9805F6YK59 57 aa9.86□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hbb-b2P02089 147 aa9.85□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa9.84□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa9.84□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anapc13Q8R034 74 aa9.84□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm17577J3QNF7 156 aa9.84□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ufsp1Q9CZP0 217 aa9.84□□□□□ -0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10251J3QPM5 127 aa9.82□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa9.82□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv10-3A0A075B5T6 119 aa9.81□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MrapQ9D159 127 aa9.81□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 2310034G01RikA0A286YDL3 209 aa9.81□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klk12B2RVZ0 247 aa9.81□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sprr1aQ62266 144 aa9.81□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Camk2n2Q78WH7 79 aa9.79□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Notch1Q01705 2531 aa9.79□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa9.79□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q9DAA7 145 aa9.79□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col6a5A6H584 2640 aa9.79□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm16485Q8C4B7 115 aa9.78□□□□□ -0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Csmd3Q80T79 3707 aa9.77□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm7276Q3TYW4 209 aa9.77□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Msrb1Q9JLC3 116 aa9.77□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A286YCN5 57 aa9.77□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Elof1P60003 83 aa9.77□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv2-109A0A075B5K6 120 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ntn5Q3UQ22 452 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-26A0A075B5N5 123 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sslp1Q3UN54 99 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-27A0A0G2JF28 120 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-30A0A140T8M3 121 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm7102J3QQ10 178 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm11627A6PWP4 55 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63 ms