RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000050063.8

Arf6-201, Transcript of ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Arf6, Length 1,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm26727M0QWT1 121 aa15,25■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm9903Q8C9Y8 129 aa15,25■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa15,24■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Dpm2Q9Z324 84 aa15,24■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Krtap13O88375 197 aa15,23■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Hbb-b2P02089 147 aa15,23■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Wfdc12Q9JHY3 85 aa15,23■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm10065F6TJM2 114 aa15,22■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Pou2af1Q64693 256 aa15,22■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Triap1Q9D8Z2 76 aa15,22■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa15,21■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 1700011M02RikB1AX35 88 aa15,21■□□□□ 0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Trav13-2A0A075B649 110 aa15,2■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm29289A0A087WPY7 166 aa15,2■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Tex54G3UW99 86 aa15,2■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Smim1P0C8K7 78 aa15,19■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 MifP34884 115 aaKnown RBP15,19■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa15,19■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Ryr1E9PZQ0 5035 aa15,19■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 PkigO70139 76 aa15,18■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Scgb1b15A0A087WP50 93 aa15,17■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Defa23Q5G866 93 aa15,17■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Cited1P97769 203 aa15,17■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm28269A0A087WSG3 125 aa15,16■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm10518F6UQQ9 182 aa15,16■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Pfn2Q9JJV2 140 aa15,16■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Krtap29-1A2A5X4 342 aa15,15■□□□□ 0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Plscr4P58196 326 aa15,13■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa15,12■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Sostdc1Q9CQN4 206 aa15,12■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Defa27F2Z403 93 aa15,12■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Defb45Q3V490 66 aa15,12■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 1600014C23RikQ9DAX4 101 aa15,12■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Timm17bQ9Z0V7 172 aa15,12■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Reg3dQ9QUS9 175 aa15,11■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 SacsQ9JLC8 4582 aa15,11■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Znf414Q9DCK4 299 aa15,1■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Pkhd1E9PZ36 4059 aa15,1■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Ube2d4D3YUH6 135 aa15,09■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Wfdc6bF6ULY1 148 aa15,09■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP15,09■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Zcchc13Q9D548 170 aa15,09■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Fam168bQ80XQ8 194 aa15,08■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Uqcc3Q8K2T4 89 aa15,08■□□□□ 0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm11020F6ZGD5 61 aa15,07■□□□□ 0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Vamp8O70404 101 aa15,07■□□□□ 0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Trav4d-3A0A075B625 110 aa15,07■□□□□ 0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm10577Q3UDV9 132 aa15,07■□□□□ 0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Ntn5Q3UQ22 452 aa15,07■□□□□ 0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Ccl17F6R5P4 103 aa15,06■□□□□ 0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa15,04■□□□□ -0
Arf6-201ENSMUST00000050063 ApobE9Q414 4505 aa15,04■□□□□ -0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Tal2Q62282 108 aa15,02■□□□□ -0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Fam19a1Q7TPG8 133 aa15,02■□□□□ -0
Arf6-201ENSMUST00000050063 Fam104aA2A6P4 185 aa15,02□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Obox2E9PXV9 151 aa15,02□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Glrp1E9Q9S8 174 aa15,02□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Cops9Q3U898 57 aa15,02□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Fam19a5Q91WE9 132 aa15,02□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Prol1E9PYQ4 312 aa15,01□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Tcl1b3P56842 122 aa15□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Pglyrp4Q0VB07 374 aa15□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Defa20Q45VN2 95 aa14,99□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP14,99□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa14,97□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Ighv2-5A0A0A6YY69 116 aa14,97□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 P01821 116 aa14,97□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Defb9Q8R2I6 67 aa14,97□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa14,97□□□□□ -0,01
Arf6-201ENSMUST00000050063 Defa3P28310 93 aa14,96□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Cox7bP56393 80 aa14,96□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm10845Q3UNY9 185 aa14,96□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa14,94□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Igkv8-18A0A0B4J1J3 123 aa14,93□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Lst1O08843 95 aa14,93□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 ScxQ64124 207 aa14,93□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa14,93□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 BC107364E9Q5A2 140 aa14,92□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP14,92□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP14,92□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Slamf6Q9ET39 351 aa14,92□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 P84750 121 aa14,91□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Lage3Q9CR70 148 aa14,91□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gemin7Q9CWY4 129 aa14,9□□□□□ -0,02
Arf6-201ENSMUST00000050063 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP14,89□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Csdc2Q91YQ3 154 aa14,89□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 MalO09198 153 aa14,88□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm6793B2RXM2 351 aa14,87□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Wdr38Q9D994 303 aa14,87□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Gm5153P01627 120 aa14,87□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Ociad2Q9D8W7 154 aa14,86□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa14,85□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 S100a8P27005 89 aa14,85□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Defa4P28311 92 aa14,85□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Smim29Q8R043 75 aa14,85□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 A330070K13RikQ8CA53 115 aa14,84□□□□□ -0,03
Arf6-201ENSMUST00000050063 Adm2Q7TNK8 150 aa14,83□□□□□ -0,04
Arf6-201ENSMUST00000050063 Igkv1-117A0A140T8M0 119 aa14,82□□□□□ -0,04
Arf6-201ENSMUST00000050063 Dmac1Q9CQ00 111 aa14,82□□□□□ -0,04
Arf6-201ENSMUST00000050063 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa14,82□□□□□ -0,04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48,5 ms