RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa15.05■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa15.04■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klk12B2RVZ0 247 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10845Q3UNY9 185 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klk11Q9QYN3 276 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smim20D3Z7Q2 69 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa25Q5G864 92 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv2-109A0A075B5K6 120 aa15.02□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10518F6UQQ9 182 aa15.01□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10320E9PW43 113 aa15□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa14.99□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa14.99□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SmcpP15265 143 aa14.99□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa20Q45VN2 95 aa14.99□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa14.98□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcl1b3P56842 122 aa14.98□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klk9Q32M27 251 aa14.98□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tenm1Q9WTS4 2731 aa14.96□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CicQ924A2 2510 aa14.95□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa14.95□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Reg3dQ9QUS9 175 aa14.95□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa14.94□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cmc4Q61908 68 aa14.94□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CnbpP53996 178 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q9DAA7 145 aa14.94□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01819 144 aa14.93□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 D130052B06RikQ3UW13 202 aa14.93□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Csdc2Q91YQ3 154 aa14.93□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa14.92□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cystm1Q8K353 104 aa14.92□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cox7bP56393 80 aa14.91□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa2P28309 93 aa14.9□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EnhoQ8K1D8 76 aa14.9□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa14.89□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa14.89□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv3-1A0A075B5P1 119 aa14.88□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9805F6YK59 57 aa14.88□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9903Q8C9Y8 129 aa14.88□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv10-3A0A075B5T6 119 aa14.86□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ntn5Q3UQ22 452 aa14.86□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 E130208F15RikQ3UPV3 143 aa14.85□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11213A0A1B0GR83 88 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A0A286YCN5 57 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv13-2A0A0A6YWN3 119 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm20726G3UX18 150 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ScxQ64124 207 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-27A0A0G2JF28 120 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-30A0A140T8M3 121 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ube2d4D3YUH6 135 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcl1b5P56845 121 aa14.82□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm3618D3Z4P5 127 aa14.81□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm2916Q9D9B9 127 aa14.81□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snhg11Q4G0K9 87 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PolqQ8CGS6 2544 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem254aP0DN89 123 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem254bP0DN90 123 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem254cP0DN91 123 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AY074887Q8R5F9 132 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-26A0A075B5N5 123 aa14.79□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa14.79□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa14.78□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ApcQ61315 2845 aa14.78□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naa38Q9D2U5 125 aa14.77□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Itpr2Q9Z329 2701 aa14.77□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Msrb1Q9JLC3 116 aa14.77□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa7P50705 93 aa14.76□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ormdl1Q921I0 153 aa14.76□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AtrQ9JKK8 2635 aa14.76□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10770F7D043 238 aa14.75□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MplkipQ9D011 178 aa14.75□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa14.75□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam19a1Q7TPG8 133 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10308Q9CVR5 141 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ufsp1Q9CZP0 217 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7138L7N2C3 230 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lamtor3O88653 124 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm3238W4VSP7 230 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17509Q9CZ61 145 aa14.73□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa14.72□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Notch2O35516 2470 aa14.71□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 2310034G01RikA0A286YDL3 209 aa14.71□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SvipQ3UZP4 77 aa14.7□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa14.7□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Reg3bP35230 175 aa14.7□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa14.69□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 9530003J23RikQ8BM26 151 aa14.69□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cox7b2Q9D2H1 82 aa14.68□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa14.68□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17577J3QNF7 156 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa21Q8C1P2 93 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubl5Q9EPV8 73 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 9430015G10RikA2ASP7 199 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serp2Q6TAW2 65 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defb37Q7TMD2 62 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 96.2 ms