RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000227089.1

Ankrd28-204, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

BASIC

Gene Ankrd28, Length 3,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Timm17bQ9Z0V7 172 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm15557A6PWY0 234 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tcte2E9PY37 120 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01819 144 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01820 115 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 GhrhP16043 103 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 SbsponQ3UPR9 264 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav9-2A0A075B647 113 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm26661M0QWV4 156 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fhl2O70433 279 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 TeppQ6IMH0 216 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Q9DAB9 146 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 C2cd3Q52KB6 2323 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sh2d1aO88890 126 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 H2al1aQ5M8Q2 105 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Spata25Q9DA57 226 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 H2al1bA0A087WP11 105 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 H2al1kJ3QP08 105 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm815Q3UWS2 115 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Eif4ebp1Q60876 117 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 H2al1eQ810S6 105 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tm2d2Q8R0I4 213 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 MplkipQ9D011 178 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 H2al1mQ9DAD9 105 aa3.41□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa3.4□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm17472A0A075B683 117 aa3.4□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa3.4□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01823 113 aa3.4□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cox17P56394 63 aa3.4□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Defb33Q30KN3 62 aa3.4□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 1810032O08RikE9PZV8 113 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Defa27F2Z403 93 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01738 130 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-72P01751 139 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmem254aP0DN89 123 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmem254bP0DN90 123 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmem254cP0DN91 123 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 SmcpP15265 143 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ang3P97802 145 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 CicQ924A2 2510 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv5-8A0A075B676 92 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 MifP34884 115 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Acyp1P56376 99 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Spata3Q9D9T6 193 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tenm4Q3UHK6 2771 aa3.4□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Notch1Q01705 2531 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nsun4C4P6S0 806 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nupr2Q497P3 102 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ubl5Q9EPV8 73 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv4-53A0A0G2JFC6 119 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 MsmbO08540 113 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Serp2Q6TAW2 65 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmem258P61166 79 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cd164Q9R0L9 197 aa3.39□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv2-3A0A075B696 115 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01786 117 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 AI854703Q8BIN3 203 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tomm7Q9D173 55 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 PolqQ8CGS6 2544 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Csmd3Q80T79 3707 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Col6a5A6H584 2640 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Stab1Q8R4Y4 2571 aa3.38□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm11011D3Z3L9 86 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Obox2E9PXV9 151 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm9887F6RFI0 207 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm10490F6VBM2 120 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Chtf8P0CG14 533 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tcl1b5P56845 121 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Lmo4P61969 165 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm10837Q3UTT8 145 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 ScxQ64124 207 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cd164l2Q9D6W7 172 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Znf580Q9DB38 172 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm17521F6QAC8 156 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm9922Q8C3P1 144 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 1700011M02RikB1AX35 88 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm10322F7D7I4 111 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sprr3O09116 238 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 BikO70337 150 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Dad1P61804 113 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Eif4ebp3Q80VV3 101 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm9747Q810H1 104 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa3.37□□□□□ -1.87
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Esm1Q9QYY7 184 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.4 ms