RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000193170.1

Ccdc71-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm12888Q3UW77 119 aa6.71□□□□□ -1.33
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cypt14J3QPF7 87 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 GhrhP16043 103 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Arhgap32Q811P8 2089 aa6.71□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-81A0A0G2JEY5 119 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 NpwA0A1L1STR8 176 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Fam19a4Q7TPG5 135 aa6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Spg11Q3UHA3 2430 aa6.69□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Smim26Q3V460 107 aa6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 9130230L23RikQ8CC80 163 aa6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm14137Q8CE97 175 aa6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Fam104aA2A6P4 185 aa6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm4763Q8CFJ5 196 aa6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Spint4Q9D263 159 aa6.67□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv14-2A0A075B5R7 117 aa6.67□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm29644A0A087WPG2 191 aa6.67□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ly6c2P0CW03 131 aa6.67□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cystm1Q8K353 104 aa6.67□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Atp6v0e1Q9CQD8 81 aa6.67□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa6.66□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm2564F6Z9S8 108 aa6.66□□□□□ -1.34
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ccl19O70460 108 aa6.66□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa6.66□□□□□ -1.34
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm5941Q497P9 117 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Q4KKZ1 196 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Celsr2Q9R0M0 2920 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm17727E9Q4V7 109 aa6.63□□□□□ -1.35
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm5294J3QP53 216 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Smim1P0C8K7 78 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gphb5Q812B2 130 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Dido1Q8C9B9 2256 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa6.63□□□□□ -1.35
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ang2Q64438 145 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Phpt1Q9DAK9 124 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 OtoglF7A4A7 2325 aa6.62□□□□□ -1.35
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm5142Q8C5X9 133 aa6.62□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa6.61□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa6.61□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defa27F2Z403 93 aa6.61□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 SbsponQ3UPR9 264 aa6.61□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cspg4Q8VHY0 2327 aa6.61□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-57A0A0A6YYE7 117 aa6.61□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa6.61□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Csn3P06796 181 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 SrarpQ3ULG3 163 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 CnfnQ6PCW6 111 aa6.6□□□□□ -1.35
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