RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4861Q8C5A4 106 aa9.64□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vsig4F6TUL9 280 aa9.64□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700056E22RikF7CNM6 234 aa9.64□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01747 120 aa9.64□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cfc1P97766 202 aa9.64□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crlf1Q9JM58 425 aa9.64□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-74A0A0B4J1I3 119 aa9.64□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hbb-b2P02089 147 aa9.63□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa9.63□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20730A0A075B5J6 119 aa9.63□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MturnQ8CGA4 131 aa9.63□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fhl2O70433 279 aa9.63□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NpsP0C0P8 89 aa9.63□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Morn5Q9DAI9 170 aa9.63□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa1549Q68FD9 1940 aa9.63□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itpr1P11881 2749 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufa1O35683 70 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sfta2E9PXB6 77 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tal2Q62282 108 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znhit3Q9CQK1 151 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D131 166 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtprqP0C5E4 2300 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A530064D06RikQ8BNV8 229 aa9.62□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E130114P18RikF6S0S7 154 aa9.61□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FshbQ60687 130 aa9.61□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa9.61□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D8Q6 235 aa9.61□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd27P41272 250 aa9.61□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep192E9Q4Y4 2514 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav4n-4A0A075B615 110 aa9.61□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam222aQ6PGH4 453 aa9.61□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnrc18Q80WC3 2878 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smrp1Q2MH31 260 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SpinklQ8CEK3 90 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrlhG3UWC3 86 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rmi2Q3UPE3 149 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxc1Q61572 553 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl35Q9CQL6 188 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa28D3Z1V9 94 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7102J3QQ10 178 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LeprotO89013 131 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PemtQ61907 199 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ebi3O35228 228 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lgals4Q8K419 326 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mpv17l2Q8VIK2 200 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Timm17aQ9Z0V8 171 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav13d-1A0A075B606 110 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl32-psP17932 135 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp951A0A087WRH0 451 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube2v1Q9CZY3 147 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fxyd5P97808 178 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-61A0A0G2JH00 117 aa9.57□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spry2Q9QXV8 315 aa9.57□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxi2Q3I5G5 311 aa9.57□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klk5Q9D140 293 aa9.57□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CicQ924A2 2510 aa9.57□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nbeal1E9PYP2 2688 aa9.57□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10767Q3TQP0 103 aa9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znrf2Q71FD5 238 aa9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pxt1Q8K459 51 aa9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HttP42859 3119 aa9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Reg3bP35230 175 aa9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC048502Q80Y74 154 aa9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp9yF8VPU6 2556 aa9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa9.56□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NpyP57774 97 aa9.55□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HampQ9EQ21 83 aa9.55□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa1P11477 93 aa9.55□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tm2d2Q8R0I4 213 aa9.55□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh2d1aO88890 126 aa9.55□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LhbO09108 141 aa9.54□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lage3Q9CR70 148 aa9.54□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hectd1Q69ZR2 2618 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lamtor3O88653 124 aa9.54□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Jbts17Q8CE72 3214 aa9.54□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C1qcQ02105 246 aa9.53□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav13d-4A0A0G2JFX3 110 aa9.53□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa9.53□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam241bQ9D882 120 aa9.53□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snai3Q9QY31 287 aa9.53□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-85A0A075B5Y6 117 aa9.53□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01837 106 aa9.53□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa9.52□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defb29Q8BGW9 78 aa9.52□□□□□ -0.88
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MalO09198 153 aa9.52□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col12a1Q60847 3120 aa9.52□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufa3Q9CQ91 84 aa9.52□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa9.52□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10542F6XDR3 90 aa9.52□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrygfQ9CXV3 174 aa9.52□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smim26Q3V460 107 aa9.51□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chd7A2AJK6 2986 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa9.51□□□□□ -0.89
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10604Q3V0X7 143 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 78 ms