RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm933J3QPC1 141 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prr3Q811B5 190 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PmvkQ9D1G2 192 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tln1P26039 2541 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P01739 132 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm11444F6QMA6 170 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Defb47Q30KN1 79 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 F11rO88792 300 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P06328 117 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ifitm10Q8BR26 201 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ash1lQ99MY8 2958 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trbv17A0A140T8P8 114 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 FshbQ60687 130 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 BC106179Q8C9L1 186 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Phlda3Q9WV95 125 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Med13lQ6JPI3 2207 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P01811 117 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm21748Q3UE70 102 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lyzl4Q9D925 145 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Iah1Q9DB29 249 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cxcl14Q9WUQ5 99 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Edn3P48299 214 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpl32P62911 135 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sec16aA2AIX1 2377 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gphb5Q812B2 130 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ankrd39Q9D2X0 183 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zc2hc1bQ9D534 172 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P84751 237 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cyyr1Q8VIH7 165 aa14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Timm17aQ9Z0V8 171 aa14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem213Q08EA8 116 aa14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10251J3QPM5 127 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lect2O88803 151 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 FcorP0DJI6 106 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ube2e1P52482 193 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mrpl35Q9CQL6 188 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ptprz1B9EKR1 2312 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Armcx4E9PWM3 2356 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ColqO35348 457 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpl32-psP17932 135 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 LhbO09108 141 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 C1qcQ02105 246 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 1500011B03RikQ3TTH7 73 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem219Q9D123 240 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm28539A0A087WSL9 92 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 LeprotO89013 131 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P01750 117 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Muc4Q8JZM8 3443 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mpv17l2Q8VIK2 200 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lyrm7Q9DA03 104 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Higd1aQ9JLR9 95 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Defb20Q30KP3 96 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ins2P01326 110 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem263Q9DAM7 115 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lce6aD3YV94 81 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atp5g3P56384 141 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mzt1Q8BUR9 78 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mettl26Q9DCS2 204 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chd8Q09XV5 2582 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9970F6ZED4 185 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NbasE9Q411 2356 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tcte2E9PY37 120 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mfap4Q9D1H9 257 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P01726 129 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10735Q3US96 136 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdr38Q9D994 303 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rbmy1bQ60990 380 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm17732E9Q5I2 61 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Psmb8P28063 276 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rasl11bQ922H7 247 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Xlr5cQ9JJR2 179 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm26661M0QWV4 156 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm17334Q8C6U3 126 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ndufb4Q9CQC7 129 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smim20D3Z7Q2 69 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Defa26Q3L180 93 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prr9Q8BV84 116 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm6793B2RXM2 351 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 March3Q8BRX9 218 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm15557A6PWY0 234 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pglyrp1O88593 182 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Spink10Q8CAC8 162 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam208bQ5DTT3 2382 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ep300B2RWS6 2412 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm20499D3Z4G5 72 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 74.4 ms