RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01750 117 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9D727 114 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trav8-1A0A075B641 109 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pla2g2aP31482 146 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spink13Q3UTS8 97 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrk2Q5S006 2527 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 S100a8P27005 89 aa12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cby1Q9D1C2 127 aa12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pkd1l2Q7TN88 2461 aa12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01741 114 aa12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01837 106 aa12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9CX63 252 aa12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defb45Q3V490 66 aa12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LhbO09108 141 aa12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P06328 117 aa12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cks1brtQ3UNC9 96 aa12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr313Q5NC55 308 aa12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MsmbO08540 113 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sprr3O09116 238 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sap30O88574 220 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Csn3P06796 181 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc16a4Q8R0M8 500 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hrct1Q9D6B9 109 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pradc1Q9D9N8 188 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itpr3P70227 2670 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prr3Q811B5 190 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17430F6RSK3 157 aa12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A730046J19RikA0A1B0GSN8 89 aa12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trav7-2Q5R1I3 112 aa12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slamf6Q9ET39 351 aa12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcrg-C3L7N479 172 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P03985 172 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Egr2P08152 470 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem170bP86050 132 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pip4p1Q3TWL2 284 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcf24V9GWT9 166 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itpr1P11881 2749 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vamp8O70404 101 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01643 108 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prss29Q99MS4 279 aa12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LrbaQ9ESE1 2856 aa12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01812 117 aa12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PlaurP35456 327 aa12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hint1P70349 126 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf580Q9DB38 172 aa12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rs1Q9Z1L4 224 aa12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl39P62892 51 aa12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Foxi1Q922I5 372 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plac1Q9JI83 173 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm42674D3YUT9 64 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam240aJ3QNP9 97 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lgals6O54891 301 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C1qcQ02105 246 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10295Q8CCF3 114 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AamdcQ8R0P4 122 aa12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10271F6WY25 52 aa12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndufb4Q9CQC7 129 aa12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap26-1Q9D7N2 215 aa12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Esp4A8R0T8 117 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccl19O70460 108 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10226O88253 85 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PolP10400 120 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SrarpQ3ULG3 163 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr2kQ63871 58 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa37K9J724 93 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa5P28312 93 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gphb5Q812B2 130 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wfdc15aQ8BH89 80 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ovol2Q8CIV7 274 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PmvkQ9D1G2 192 aa12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usmg5Q78IK2 58 aa12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 OtoglF7A4A7 2325 aa12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem262D3Z338 116 aa12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa-rs7P50715 91 aa12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BC025920Q3US60 128 aa12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9D8Q6 235 aa12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bri3P28662 125 aa12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smr3aQ61900 147 aa12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LbhQ9CX60 105 aa12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iah1Q9DB29 249 aa12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem238A9JSM3 176 aa12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm45753A0A1C7CYU8 86 aa12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1500011B03RikQ3TTH7 73 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 81.4 ms