RNA–Protein interactions for RNA: YOR279C

RFM1, Transcript of Component of the Sum1p-Rfm1p-Hst1p complex, yeast

Gene RFM1, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFM1	YOR279C	GTR1	Q00582	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	SSM4	P40318	1319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	USO1	P25386	1790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	BEM3	P32873	1128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	LTP1	P40347	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	IMA5	P40884	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	MAD2	P40958	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	PMT6	P42934	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	SPO1	P53541	631 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	ULA1	Q12059	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	HMG2	P12684	1045 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	CWH43	P25618	953 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	PRE4	P30657	266 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	PRM2	P40534	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	GAT1	P43574	510 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	PEF1	P53238	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	SNF12	P53628	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	YNR071C	P53757	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	UFO1	Q04511	668 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	SSP2	Q08646	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	PDR10	P51533	1564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TPK2	P06245	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	NUP1	P20676	1076 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	PSY4	P38193	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	SPC72	P39723	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	XBP1	P40489	647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TAX4	P47030	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	NET1	P47035	1189 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	COG4	Q06096	861 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	IZH3	Q07959	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	AIM41	Q12032	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	DIN7	Q12086	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFM1	YOR279C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	URA3	P03962	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	NUC1	P08466	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	APN1	P22936	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	SMK1	P41808	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	ARG7	Q04728	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	TRI1	Q05024	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	CIA1	Q05583	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	POL3	P15436	1097 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	ARG1	P22768	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	RPN12	P32496	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	MTC7	P32633	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	ELF1	P36053	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	YLF2	P38746	405 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	PCK1	P10963	549 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	TUP1	P16649	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	CLB4	P24871	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	RER1	P25560	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	MCM10	P32354	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
RFM1	YOR279C	FTR1	P40088	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	PUG1	P40100	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	RAD26	P40352	1085 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	PSF2	P40359	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	YGL117W	P53133	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	ACS1	Q01574	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	SEC12	P11655	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	STE4	P18851	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	SIR1	P21691	654 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	CHS3	P29465	1165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	XRS2	P33301	854 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	MRPL36	P36531	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	CDS1	P38221	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	EHT1	P38295	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	MNT3	P40549	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFM1	YOR279C	ARA2	Q04212	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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