RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DIF1O13577 133 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HMG2P12684 1045 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MAK31P23059 88 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W BUD2P33314 1104 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MTH1P35198 433 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SAP190P36123 1033 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PPS1P38148 807 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YBR259WP38338 688 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W OSH3P38713 996 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W BAP3P41815 604 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MAL11P53048 616 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W STP1Q00947 519 aa2.46□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CSF1Q12150 2958 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W OPI1P21957 404 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W GSY1P23337 708 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MEF1P25039 761 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PEX6P33760 1030 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MTC2P34246 357 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HOS4P40480 1083 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ASE1P50275 885 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ALT2P52892 507 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ORC4P54791 529 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W DOS2P54858 310 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CRD1Q07560 283 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TGL5Q12043 749 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W WHI2P12611 486 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W RSA4P25382 515 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PEX34P25584 144 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PCM1P38628 557 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W FMP52P40008 231 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SHR5P41912 237 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W GND2P53319 492 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YAT1P80235 687 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W UGO1Q03327 502 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YMR206WQ03695 313 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YDR338CQ05497 695 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PLP2Q12017 286 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YGR161W-CQ3E744 92 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MDM12Q92328 271 aa2.45□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W COX4P04037 155 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SIR3P06701 978 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SES1P07284 462 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W VBA3P25594 458 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PWP2P25635 923 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TMT1P32643 299 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W VID28P40547 921 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W LAM5P43560 674 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ALY2P47029 1046 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YJR142WP47173 342 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SLG1P54867 378 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TFB2Q02939 513 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W NSE5Q03718 556 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PHM6Q05637 104 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W COQ9Q05779 260 aa2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data2.44□□□□□ -2.02not detected
SSQ1YLR369W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PGK1P00560 416 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CDC9P04819 755 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W GLN3P18494 730 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SPO11P23179 398 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PGS1P25578 521 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SFP1P32432 683 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W UTH1P36135 365 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HMT1P38074 348 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W BCD1P38772 366 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MED6P38782 295 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TPM2P40414 161 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W GPD2P41911 440 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W BNA2P47125 453 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W UBC11P52492 156 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TEL2P53038 688 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YAP1802P53309 568 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W GAD1Q04792 585 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ASM4Q05166 528 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CRR1Q05790 422 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TFC6Q06339 672 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W IRC13Q08630 104 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HIF1Q12373 385 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MAS1P10507 462 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HCA4P20448 770 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PDE1P22434 369 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W STO1P34160 861 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W DUG2P38149 878 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data2.43□□□□□ -2.02not detected
SSQ1YLR369W CCT3P39077 534 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W EAF5P39995 279 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W VPS27P40343 622 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ATF1P40353 525 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CAF16P43569 289 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TEX1P53851 422 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
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