RNA–Protein interactions for RNA: YLR018C

POM34, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene POM34, Length 900 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POM34	YLR018C	HSF1	P10961	833 aa		10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	APE1	P14904	514 aa		10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	PPH22	P23595	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	COQ8	P27697	501 aa		10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	SAF1	P38352	637 aa		10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	MOB1	P40484	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	ERR3	P42222	437 aa		10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	HOS1	Q12214	470 aa		10.14	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	ADD66	P36040	267 aa		10.13	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	FUI1	P38196	639 aa		10.13	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	ATG12	P38316	186 aa		10.13	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	TIM13	P53299	105 aa		10.13	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	COX5A	P00424	153 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	URA10	P30402	227 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	SGE1	P33335	543 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	VAC8	P39968	578 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	UBP7	P40453	1071 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	YFL012W	P43580	148 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	YLR012C	Q07927	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	YCL068C	P25593	260 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	NDI1	P32340	513 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	FAP1	P53971	965 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	NSE5	Q03718	556 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	PGC1	Q08959	321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	OCA6	Q12454	224 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	PEX5	P35056	612 aa		10.1	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	SPC97	P38863	823 aa		10.1	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	YNR063W	P53749	607 aa		10.1	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	REG1	Q00816	1014 aa		10.1	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	TOF2	Q02208	771 aa		10.1	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	PEX15	Q08215	383 aa		10.1	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		10.1	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	ETR1	P38071	380 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	ELO3	P40319	345 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	DSN1	P40568	576 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	PXA1	P41909	870 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	GND2	P53319	492 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	TEP1	P53916	434 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	SEG1	Q04279	960 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	YET3	Q07451	203 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	VHS3	Q08438	674 aa		10.09	□□□□□ -0.79
POM34	YLR018C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	RAM1	P22007	431 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	AMS1	P22855	1083 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	MSH1	P25846	959 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	KAR9	P32526	644 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	VPS41	P38959	992 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	AMA1	P50082	593 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	SIW14	P53965	281 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	CDC14	Q00684	551 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	SGO1	Q08490	590 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	NDD1	Q08887	554 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	GPA2	P10823	449 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	SIR1	P21691	654 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	YCR051W	P25631	222 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	TGL4	P36165	910 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	MRPL40	P36534	297 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	RAD26	P40352	1085 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	LSB6	P42951	607 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	MET14	Q02196	202 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	YMR206W	Q03695	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	PML39	Q03760	334 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	FAR8	Q05040	523 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	NCA2	Q12374	616 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.06	□□□□□ -0.8	not detected
POM34	YLR018C	SMI1	P32566	505 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	SRP101	P32916	621 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	APM3	P38153	483 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	SLX8	P40072	274 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	RRN7	P40992	514 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	TRS85	P46944	698 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	HST2	P53686	357 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	RSC4	Q02206	625 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	YPL014W	Q02606	381 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	LDB18	Q07887	179 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
POM34	YLR018C	SLD7	Q08457	257 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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