RNA–Protein interactions for RNA: YJL172W

CPS1, Transcript of Vacuolar carboxypeptidase S, yeast

Gene CPS1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPS1	YJL172W	MOD5	P07884	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	MIP1	P15801	1254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	MSH2	P25847	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	SMI1	P32566	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	TFB1	P32776	642 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YME1	P32795	747 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	UBP11	P36026	717 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YHI9	P38765	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	DYS1	P38791	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YHR131C	P38835	850 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	TDA11	P38854	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	REV7	P38927	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	INA22	P40576	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	SAP185	P40856	1058 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	ZIP2	P53061	704 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	PCL10	P53124	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	COG6	P53959	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	SPC24	Q04477	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	GAD1	Q04792	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	EAF1	Q06337	982 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	TMA16	Q08687	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	ATP16	Q12165	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	RMP1	Q12530	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	STE3	P06783	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	NMT1	P14743	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YUR1	P26725	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	PAH1	P32567	862 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	NPL6	P32832	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YKL050C	P35736	922 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	PEX32	P38292	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YEL076C	P39971	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	NDE1	P40215	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	TOK1	P40310	691 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	QDR2	P40474	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	FIS1	P40515	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	GTR1	Q00582	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	IVY1	Q04934	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	VAC14	Q06708	880 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	REX3	Q12090	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	BMT6	Q12291	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	IES3	Q12345	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPS1	YJL172W	YPR089W	O13585	888 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	POX1	P13711	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SNA3	P14359	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	OM45	P16547	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	DAP2	P18962	818 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	DBF2	P22204	572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	NPP1	P25353	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ATO2	P32907	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	CPR5	P35176	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YER186C	P40101	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	AXL1	P40851	1208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TOM22	P49334	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	CTR1	P49573	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	GUP1	P53154	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ERP6	P53198	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SPC2	Q04969	178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	OSW2	Q12202	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	CDC8	P00572	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	AFT1	P22149	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	VAC17	P25591	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	GUT2	P32191	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PPS1	P38148	807 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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