RNA–Protein interactions for RNA: YGL154C

LYS5, Transcript of Phosphopantetheinyl transferase involved in lysine biosynthesis, yeast

Gene LYS5, Length 819 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYS5	YGL154C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	SRD1	P09007	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	RPO26	P20435	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	SPO11	P23179	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	CDC20	P26309	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	KAR9	P32526	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	ATG19	P35193	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	LHS1	P36016	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	PCI8	P40512	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	BTN2	P53286	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	SPC98	P53540	846 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	YNL146W	P53906	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	CSM3	Q04659	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	ECM7	Q06200	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	IES4	Q08561	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LYS5	YGL154C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PMR1	P13586	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	GAL11	P19659	1081 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SIR1	P21691	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PEX14	P53112	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	RTT102	P53330	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	VTC3	Q02725	835 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	TMA10	Q06177	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	VPS5	Q92331	675 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	GAL80	P04387	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	GSY1	P23337	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	COT1	P32798	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	LST4	P34239	828 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SRL3	P36167	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PIM1	P36775	1133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	BRN1	P38170	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	VID24	P38263	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PPX1	P38698	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	ERC1	P38767	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	CAJ1	P39101	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	YIL001W	P40560	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	YJR142W	P47173	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	CUL3	P53202	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	DSL1	P53847	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SSL2	Q00578	843 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	KRE28	Q04431	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	OSW2	Q12202	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	TRA1	P38811	3744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	CHS6	P40955	746 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	STB4	P50104	949 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SUN4	P53616	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SEC5	P89102	971 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	HOT1	Q03213	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	FAR8	Q05040	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	FUS2	Q05670	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
LYS5	YGL154C	NTO1	Q12311	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	TUP1	P16649	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	GPI10	P30777	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	ASF1	P32447	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SEC66	P33754	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	YPT53	P36019	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	HXT13	P39924	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	PIC2	P40035	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	TRS85	P46944	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	ORM1	P53224	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	YAT1	P80235	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	SVS1	Q12254	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYS5	YGL154C	IES3	Q12345	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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