RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W TY1A-ORP0CX59 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-PR2P0CX60 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-DR5P0CX65 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-ER2P0CX66 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-GR3P0CX67 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-LR1P0CX68 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-MR2P0CX69 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W IDI1P15496 288 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W URA7P28274 579 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W PMI40P29952 429 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W GCD11P32481 527 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W UTR2P32623 467 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W OTU2P38747 307 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SFB3P38810 929 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YAT2P40017 923 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W RTT101P47050 842 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-JR2P47099 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W MRX6P48564 524 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ZIP2P53061 704 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data9.12□□□□□ -0.95 RIP-Chip
DDI1YER143W TY1A-DR1Q03856 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W PIG1Q06216 648 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W OMS1Q06668 471 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W NRT1Q08485 598 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YPQ1Q12010 308 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-BRQ12217 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-NL2Q12470 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-GR2Q12485 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ENO2P00925 437 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TEF1P02994 458 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SEC2P17065 759 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W PDE1P22434 369 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W KAR4P25583 335 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SRP101P32916 621 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YEL028WP39989 153 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W PXA1P41909 870 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W IML2P47031 731 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W RTA1P53047 317 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W UTP8P53276 713 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W GND2P53319 492 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W INP2Q03824 705 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SPO71Q03868 1245 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ARP9Q05123 467 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SVS1Q12254 260 aa9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DDI1YER143W HIS1P00498 297 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ERR1P0CX10 437 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ERR2P0CX11 437 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ADY2P25613 283 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YCR051WP25631 222 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W FUI1P38196 639 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W KAP104P38217 918 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YBP1P38315 674 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W NUP60P39705 539 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ERR3P42222 437 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W CNN1P43618 361 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SLT2Q00772 484 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W EAR1Q03212 550 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W MSH6Q03834 1242 aa9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
DDI1YER143W MTF1P14908 341 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
DDI1YER143W GID7P25569 745 aa9.09□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SET3P36124 751 aa9.09□□□□□ -0.95
DDI1YER143W URA8P38627 578 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SMF2P38778 549 aa9.09□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YJL132WP47014 750 aa9.09□□□□□ -0.95
DDI1YER143W PCL10P53124 433 aa9.09□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YOR387CQ08910 206 aa9.09□□□□□ -0.95
DDI1YER143W MRPL25P23369 157 aa9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SPC97P38863 823 aa9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W VPS41P38959 992 aa9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W EMW1P42842 904 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W YFL012WP43580 148 aa9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W PSP1P50896 841 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SWC7Q06707 132 aa9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W AAD15Q08361 143 aa9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W OCA6Q12454 224 aa9.08□□□□□ -0.96
DDI1YER143W COX5AP00424 153 aa9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W MET22P32179 357 aa9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W KES1P35844 434 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W DPH1P40487 425 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W DLD2P46681 530 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W NUP42P49686 430 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W COQ6P53318 479 aa9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W LSC1P53598 329 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W COP1P53622 1201 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W TEP1P53916 434 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.4 ms