RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-1

RDN25-1, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-1, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-1RDN25-1 CRD1Q07560 283 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PMA1P05030 918 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PCK1P10963 549 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PHO8P11491 566 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 VMA8P32610 256 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PGM1P33401 570 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DIA4P38705 446 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 TMN3P40071 706 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 ASI2P53895 289 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 URA4P20051 364 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data9.8□□□□□ -0.84not detected
RDN25-1RDN25-1 INP51P40559 946 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SLT2Q00772 484 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 VHS3Q08438 674 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 GET4Q12125 312 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 CDC24P11433 854 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RED1P14291 827 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MDM36Q06820 579 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 TUB1P09733 447 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MCM5P29496 775 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 STE5P32917 917 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 STV1P37296 890 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 KEL1P38853 1164 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RPH1P39956 796 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 ERO1Q03103 563 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 ATG16Q03818 150 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SMP3Q04174 516 aa9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DBP9Q06218 594 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 TIF1P10081 395 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MRM1P25270 412 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MDJ1P35191 511 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 GLG1P36143 616 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DPH1P40487 425 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DYN3Q04949 312 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SAM1P10659 382 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 HSP30P25619 332 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YTA6P40328 754 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PAC11P40960 533 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SBE2P42223 864 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 CPR7P47103 393 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 TAM41P53230 385 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YGR125WP53273 1036 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 FYV6P53913 173 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RNY1Q02933 434 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YMR010WQ03687 405 aa9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 CMK1P27466 446 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DGR2P32330 852 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 TFB1P32776 642 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MMS21P38632 267 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SPC97P38863 823 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 FIG4P42837 879 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YJR054WP47114 497 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 CNM67P53865 581 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 KIN1P13185 1064 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 GFD2P25370 566 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 COQ8P27697 501 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 CRM1P30822 1084 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SHP1P34223 423 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MIA40P36046 403 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YDR089WP38966 869 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DDI1P40087 428 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RGD2P43556 714 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YLL007CQ07799 665 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PXA2P34230 853 aa9.78□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YML020WQ03722 664 aa9.77□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MLC2Q06580 163 aa9.77□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 CCP1P00431 361 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 MSD1P15179 658 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 RGR1P19263 1082 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 YHR112CP38716 378 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 ALD5P40047 520 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 KHA1P40309 873 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 RSC4Q02206 625 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 YET3Q07451 203 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 DAP2P18962 818 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 GAP1P19145 602 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 PEX1P24004 1043 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 CSG2P35206 410 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 MGS1P40151 587 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 HER2Q03557 464 aa9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 THP3Q12049 470 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 RPT1P33299 467 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 ATP3P38077 311 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 YER186CP40101 306 aa9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 IMD3P50095 523 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 PNG1Q02890 363 aa9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 ADE13Q05911 482 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 PHO88P38264 188 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 YHL012WP38709 493 aa9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 MTG2P38860 518 aa9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 YJL055WP47044 245 aa9.76□□□□□ -0.85
RDN25-1RDN25-1 BSC5P53755 489 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms