RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 LDHCP07864 332 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MCAMP43121 646 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PXYLP1Q8TE99 480 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 GNAI2P04899 355 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SPP2Q13103 211 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA3Q9UL41 463 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM110CQ1W6H9 321 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX11Q8IYF3 940 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF280CQ8ND82 737 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TAOK2Q9UL54 1235 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CAP2P40123 477 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.651e-7■■■■■ 27.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC285556D6RIA3 1793 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAR3O75815 825 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGCS2P54868 508 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CLUAP1Q96AJ1 413 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 COA7Q96BR5 231 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB118Q96PH6 123 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP2BPQ9P2M1 347 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D2Q9BYX2 928 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PRO3102Q9H379 93 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP290O15078 2479 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L5A8MUK1 530 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRKQ9NRH2 765 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TFRCP02786 760 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3D19Q5HYK7 790 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 NR2E3Q9Y5X4 410 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CCER2I3L3R5 266 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ATAD5Q96QE3 1844 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.644e-8■■□□□ 14.3
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRA1Q86SQ6 560 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 DBNDD2Q9BQY9 259 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PI4KBQ9UBF8 816 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SIPA1L1O43166 1804 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-211ENST00000590874 JAG1P78504 1218 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNI3KQ59H18 835 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC39AQ5SRH9 613 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM57Q8N5G2 664 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC18Q9H819 358 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 AS3MTQ9HBK9 375 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MAST2Q6P0Q8 1798 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR2Q13614 643 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 POLA2Q14181 598 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GJD2Q9UKL4 321 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 BAG3O95817 575 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR18Q9BV38 432 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR108Q9NPR9 543 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 FLT1P17948 1338 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 EVI5O60447 810 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN2P17655 700 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SZT2Q5T011 3432 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGCRP04035 888 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP4CP60510 307 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM32Q13049 653 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC158Q5M9N0 1113 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MORF4L1Q9UBU8 362 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCG2P16885 1265 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 BACE1P56817 501 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX10O60683 326 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ASNSP08243 561 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SSH3Q8TE77 659 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PALD1Q9ULE6 856 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK3Q8IZD9 2030 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF11O95390 407 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZAP70P43403 619 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf115Q9H7X2 142 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TMOD4Q9NZQ9 345 aa31.44■■■□□ 2.62
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