RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GRIK5Q16478 980 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR153Q6NV75 609 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 NBPF11Q86T75 865 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TICAM2Q86XR7 235 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 BCL11AQ9H165 835 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 DCTPP1Q9H773 170 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CABP5Q9NP86 173 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MUC3AQ02505 3323 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 AK9Q5TCS8 1911 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLIM4O00461 696 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PRMT2P55345 433 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SP3Q02447 781 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K10Q02779 954 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 NFIAQ12857 509 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC28Q96AY4 2481 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L5A8MUK1 530 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf81C9J6K1 198 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 IRF6O14896 467 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPRAP18433 802 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GNAT2P19087 354 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 OSBPP22059 807 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 USP14P54578 494 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 RHBDL3P58872 404 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE3CQ15386 1083 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PI16Q6UXB8 463 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 HAUS7Q99871 368 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 EFCC1Q9HA90 598 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM17Q9Y577 477 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 EYSQ5T1H1 3165 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TLR2O60603 784 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE6AP16499 860 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CAPN2P17655 700 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 COL9A1P20849 921 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 INPP5BP32019 993 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 LRCH3Q96II8 777 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF333Q96JL9 665 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 EHD4Q9H223 541 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SH2D4AQ9H788 454 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SWAP70Q9UH65 585 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 FLT1P17948 1338 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 BTBD19C9JJ37 291 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L10C9JJH3 530 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PDHXO00330 501 aa6.73□□□□□ -1.33
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