RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA3-215ENST00000515147 COL6A3P12111 3177 aa22.27■■□□□ 1.16
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ITGA3-215ENST00000515147 A0A1W2PPC1 479 aa22.26■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 EVI5O60447 810 aa22.26■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 TRIM27P14373 513 aa22.26■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.26■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 TNNQ9UQP3 1299 aa22.26■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 SIPA1L1O43166 1804 aa22.26■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 STAP2Q9UGK3 403 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.24■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.24■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 GORABQ5T7V8 394 aa22.24■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.23■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.23■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 GSTO1P78417 241 aa22.22■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 COA7Q96BR5 231 aa22.22■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 RAI14Q9P0K7 980 aa22.22■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.22■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 MCAMP43121 646 aa22.21■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 GJD2Q9UKL4 321 aa22.21■■□□□ 1.15
ITGA3-215ENST00000515147 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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ITGA3-215ENST00000515147 SPP2Q13103 211 aa22.2■■□□□ 1.14
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ITGA3-215ENST00000515147 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.18■■□□□ 1.14
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ITGA3-215ENST00000515147 TEX11Q8IYF3 940 aa22.17■■□□□ 1.14
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.17■■□□□ 1.14
ITGA3-215ENST00000515147 CAP2P40123 477 aa22.16■■□□□ 1.14
ITGA3-215ENST00000515147 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.16■■□□□ 1.14
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ITGA3-215ENST00000515147 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.16■■□□□ 1.14
ITGA3-215ENST00000515147 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ITGA3-215ENST00000515147 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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ITGA3-215ENST00000515147 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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ITGA3-215ENST00000515147 JAG1P78504 1218 aa22.13■■□□□ 1.13
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ITGA3-215ENST00000515147 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 BAG3O95817 575 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.12■■□□□ 1.13
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