RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa27.7■■■□□ 2.03
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TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.7■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.7■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 SLAIN1Q8ND83 568 aa27.7■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.7■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 PNMA3Q9UL41 463 aa27.69■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 PLCG2P16885 1265 aa27.68■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 UBXN2AP68543 259 aa27.68■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF280CQ8ND82 737 aa27.67■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 GJA8P48165 433 aa27.66■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 SPP2Q13103 211 aa27.65■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 TREML2Q5T2D2 321 aa27.65■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
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TRDMT1-211ENST00000495022 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.64■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF208Q9H0X6 261 aa27.64■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.64■■■□□ 2.02
TRDMT1-211ENST00000495022 USP17L5A8MUK1 530 aa27.63■■■□□ 2.01
TRDMT1-211ENST00000495022 ADCY3O60266 1144 aa27.63■■■□□ 2.01
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TRDMT1-211ENST00000495022 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
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TRDMT1-211ENST00000495022 PXYLP1Q8TE99 480 aa27.63■■■□□ 2.01
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TRDMT1-211ENST00000495022 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa27.6■■■□□ 2.01
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TRDMT1-211ENST00000495022 COA7Q96BR5 231 aa27.6■■■□□ 2.01
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TRDMT1-211ENST00000495022 WDR18Q9BV38 432 aa27.6■■■□□ 2.01
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TRDMT1-211ENST00000495022 HTATIP2Q9BUP3 242 aa27.56■■■□□ 2
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27.56■■■□□ 2
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TRDMT1-211ENST00000495022 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
TRDMT1-211ENST00000495022 SGPL1O95470 568 aa27.55■■■□□ 2
TRDMT1-211ENST00000495022 MTMR2Q13614 643 aa27.55■■■□□ 2
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP85Q6P2H3 762 aa27.55■■■□□ 2
TRDMT1-211ENST00000495022 PALD1Q9ULE6 856 aa27.55■■■□□ 2
TRDMT1-211ENST00000495022 HLA-DOAP06340 250 aa27.54■■■□□ 2
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP7A1P22680 504 aa27.54■■■□□ 2
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