RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 GNAI3P08754 354 aa21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 GORABQ5T7V8 394 aa21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 SPATA5Q8NB90 893 aa21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 PTPRFP10586 1907 aa21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 MTX1Q13505 466 aa21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 RAI14Q9P0K7 980 aa21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 A0A1W2PPC1 479 aa21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 CAP2P40123 477 aa21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 HMGCS2P54868 508 aa21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 PI16Q6UXB8 463 aa21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 USP17L5A8MUK1 530 aa21.45■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.45■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.45■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.44■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 HMGCRP04035 888 aa21.44■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 TEX11Q8IYF3 940 aa21.44■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.44■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 STAP2Q9UGK3 403 aa21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 GJD2Q9UKL4 321 aa21.42■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 CEP290O15078 2479 aa21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 RPTORQ8N122 1335 aa21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 MCAMP43121 646 aa21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 GNAI2P04899 355 aa21.39■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 TRIM32Q13049 653 aa21.39■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 WDR18Q9BV38 432 aa21.39■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.39■■□□□ 1.02
PKDCC-208ENST00000490302 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 BAG3O95817 575 aa21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 BACE1P56817 501 aa21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 MTMR2Q13614 643 aa21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 NBPF3Q9H094 633 aa21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 ASNSP08243 561 aa21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 LRCH3Q96II8 777 aa21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 PLCG2P16885 1265 aa21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 CYP2B6P20813 491 aa21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 TRIB2Q92519 343 aa21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 GDF15Q99988 308 aa21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.37■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 BMP8BP34820 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 SNRKQ9NRH2 765 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 C19orf81C9J6K1 198 aa21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 PPP4CP60510 307 aa21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 HERVK_113P62684 666 aa21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 FLT1P17948 1338 aa21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 USP17L10C9JJH3 530 aa21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 TRIM27P14373 513 aa21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 JAG1P78504 1218 aa21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.34■■□□□ 1.01
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