RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489638.5

LTA-216, Transcript of lymphotoxin alpha, humanhuman

TSL 5

Gene LTA, Length 1,377 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTA-216ENST00000489638 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.03■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 CAPN2P17655 700 aa16.02■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 SPP2Q13103 211 aa16.02■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 SPATA5Q8NB90 893 aa16.02■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.02■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.02■□□□□ 0.16
LTA-216ENST00000489638 EVI5O60447 810 aa16.01■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.01■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.01■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.01■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 ALPK3Q96L96 1907 aa16.01■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 A0A1W2PPC1 479 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 GNAI3P08754 354 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 CAP2P40123 477 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 HMGCS2P54868 508 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 GSTO1P78417 241 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 NEUROD6Q96NK8 337 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 HMGCRP04035 888 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 LDHCP07864 332 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 RARSP54136 660 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 ARHGAP45Q92619 1136 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 RAI14Q9P0K7 980 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 GJD2Q9UKL4 321 aa16■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 SIPA1L1O43166 1804 aa15.99■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 MCAMP43121 646 aa15.99■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.99■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 USP17L5A8MUK1 530 aa15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 TRIM32Q13049 653 aa15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 GORABQ5T7V8 394 aa15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 NECAB2Q7Z6G3 386 aa15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 TEX11Q8IYF3 940 aa15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 STAP2Q9UGK3 403 aa15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 PLXNB2O15031 1838 aa15.97■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.97■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.97■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.97■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 JAG1P78504 1218 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 MTMR2Q13614 643 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 TRIB2Q92519 343 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 LRCH3Q96II8 777 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 WDR18Q9BV38 432 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 DNAJC18Q9H819 358 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 PI4KBQ9UBF8 816 aa15.96■□□□□ 0.15
LTA-216ENST00000489638 RPTORQ8N122 1335 aa15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 GNAI2P04899 355 aa15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 TRIM27P14373 513 aa15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 BACE1P56817 501 aa15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 C7orf61Q8IZ16 206 aa15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 TNNQ9UQP3 1299 aa15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 LAMA3Q16787 3333 aa15.95■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 PEX10O60683 326 aa15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 ADGRA1Q86SQ6 560 aa15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 GDF15Q99988 308 aa15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 NBPF3Q9H094 633 aa15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 FLT1P17948 1338 aa15.94■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 ASNSP08243 561 aa15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 PPP4CP60510 307 aa15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 SNRKQ9NRH2 765 aa15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 FOCADQ5VW36 1801 aa15.93■□□□□ 0.14
LTA-216ENST00000489638 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms