RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CCDC69A6NI79 296 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SEMA3EO15041 775 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 FOXP2O15409 715 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CBFA2T2O43439 604 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 BMP15O95972 392 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IFNAR1P17181 557 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 XBP1P17861 261 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ANTXR2P58335 489 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NLRP12P59046 1061 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 HLFQ16534 295 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 APOA5Q6Q788 366 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ALG1Q9BT22 464 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 LRP5O75197 1615 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CAMTA2O94983 1202 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 ZNF202O95125 648 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CALM1P0DP23 149 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CALM2P0DP24 149 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CALM3P0DP25 149 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 GPTP24298 496 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 UBE4AQ14139 1066 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SCARF1Q14162 830 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 DACH1Q9UI36 760 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 AP5Z1O43299 807 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 DEXIO95424 95 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CHGBP05060 677 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 HAND2P61296 217 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 KRT40Q6A162 431 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SPC24Q8NBT2 197 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 LAMB2P55268 1798 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PTGS1P23219 599 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SYKP43405 635 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PHKA1P46020 1223 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NTRK3Q16288 839 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 OLFM4Q6UX06 510 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CHST3Q7LGC8 479 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 ESR2Q92731 530 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 MTFR1LQ9H019 292 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 LY9Q9HBG7 655 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 HPSEQ9Y251 543 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 DOCK2Q92608 1830 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 GYS1P13807 737 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 POLD1P28340 1107 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NDUFA8P51970 172 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 WTAPQ15007 396 aa9.8□□□□□ -0.84
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